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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004112`

染色体: Chr02 坐标: 63413991-63416190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004112`
名称	SmilChr02G004112
描述	galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	63413991 - 63416190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011039`
GeneID	`131011039`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011039`
原始查询	`LOC131011039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1
产物	galactan beta-1%2C4-galactosyltransferase GALS1
Arabidopsis	`AT2G33570` (GALS1) glycosyltransferase family protein (DUF23) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817922] identity=66.1; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0712500` - identity=62.3; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01697 (Glyco_transf_92)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011039

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057794767.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057794767.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794767.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794767.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:63414345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:63414401`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B7
`Chr2:63414401`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B7
`Chr2:63414477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:63414570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B103,B127,B54
`Chr2:63414603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,D8
`Chr2:63414641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr2:63414675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:63414828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr2:63414870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B103,B127,B54
`Chr2:63414879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:63414961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794767.1

482 aa

241

482

Glyco_transf_92

PF01697 Glyco_transf_92 218-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794767.1`	Pfam	`PF01697`	Glyco_transf_92	Domain	218	429	1.3e-30	107.5	Glycosyltransferase family 92

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938784.1
GAGTAAAATGAAACGACGCAGAAGTTTGAAATGCAGATTGGGTGACAAAGAAAGAAGAGAAAAATGTTATGGGTATGAGACAATGATTAGATAGAAGTGCATTTCAGTAAATAAGGGGAGATCCAGGGGCGTAGATATGAATACACTAGTACAACTGGAACCGAACCCAATTAAGAAAATAAAAAATTGGAATTATATTAAAAGCGGAATAAATAAAAAGAGCCAGAAAATGTATATTCATTACATAATTTACATTACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011039
ATGAAGAAAGACGGAACTCCGCCGCCCGTCGCCGCCGCCGTCAACCCCGTCACCAAAATCTTCCTCTGCTTCGAGACCAAGTCCTTCCTCGCCACATTGCTCGGCCTCACTCTCGTCGTCGTGGTCTGGAATCTCCAGCCCTACTACGACAACATCCTCTCCACCACCCGCTGCGCCGCCGCCGCGTCTCAGCCTATAATAAAGCCCGCCCCCCTCTCCGAGAAGAAGCTCGCCGTCGCGGATCCCAACAAGCGCACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794767.1
MKKDGTPPPVAAAVNPVTKIFLCFETKSFLATLLGLTLVVVVWNLQPYYDNILSTTRCAAAASQPIIKPAPLSEKKLAVADPNKRTFQAYGSAAALFVQMGAYRGGPATFSVVGLASKPIHVFGRPWYKCEWVPNNGNASIRAKAYKMLPDWGYGRVYTVVVVNCTFSQNPNADNSGGKLMLYAYYGESLRRYEKFTAMEEAPGAYDESKFRPPYKYEYLYCGSSLYGNLSASRMREWMAYHAWFFGASSHFVFHDAGGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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