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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004184`

染色体: Chr02 坐标: 64157960-64163734 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004184`
名称	SmilChr02G004184
描述	synaptotagmin-2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64157960 - 64163734 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011106`
GeneID	`131011106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011106`
原始查询	`LOC131011106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	synaptotagmin-2
产物	synaptotagmin-2
Arabidopsis	`AT1G20080` (SYTB) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838597] identity=75; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0448400` (OsNTMC2T1.1) - identity=70.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF17047 (SMP_LBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057794865.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057794864.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057794864.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794865.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794865.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64158112`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	137	A16,A18,A19,A20,A23,A24,A3,A4,A5,A6,B104,B106,B107,B108,B109,B111,B113,B118,B119,B12,B120,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B140,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B24,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B4,B40,B41,B45,B47,B5,B51,B52,B55,B6,B60,B61,B64,B66,B68,B69,B72,B73,B74,B76,B78,B8,B82,B85,B86,B87,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C11,C12,C18,C20,C21,C23,C24,C25,C28,C30,C36,C37,C38,C39,C4,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C58,C60,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C73,C75,C79,C8,C80,C82,C86,C87,C9,D1,D11,D3,D5
`Chr2:64158229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C14,C7
`Chr2:64158318`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	42	A11,A13,A18,A5,B101,B117,B124,B128,B129,B13,B138,B139,B23,B26,B31,B42,B43,B46,B49,B5,B52,B56,B61,B65,B67,B69,B74,B76,B91,B93,B96,C22,C25,C26,C28,C61,C74,C78,C81,C83,C87,D6
`Chr2:64158649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B19,B28
`Chr2:64158860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B140,C12,C40
`Chr2:64159145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B134,B85
`Chr2:64159273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B97,C27
`Chr2:64159276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B97,C27
`Chr2:64159620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:64161782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794864.1

591 aa

296

591

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 67-248 aa PF00168 C2 260-362 aa PF00168 C2 420-488 aa

XP_057794865.1

540 aa

270

540

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 67-248 aa PF00168 C2 260-362 aa PF00168 C2 420-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794864.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	67	248	4.4e-19	69.4	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057794864.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	260	362	5.5e-41	139.7	C2 domain
`XP_057794864.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	420	488	5.5e-41	139.7	C2 domain
`XP_057794865.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	67	248	3.7e-19	69.7	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057794865.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	260	362	2.6e-44	150.4	C2 domain
`XP_057794865.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	420	522	2.6e-44	150.4	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938882.1
CCGGTTGGGATACGTTACCGTTGTCTGCCGACACACACGCGCTCCATTTTGTTGCCAAAGGCCGTTACATATGGATCCAATAGGGTCGTTGAATGCTATGCAAAGATATTTCTCCCCGGCATTAATATTTCTTTTATTTCTCGCCTCAAAATTGTATCAACTTGCAATGTGGATGTCCCTCTCCTCTTTTTGTTCTTCACTCATCCTTGTCTGGACCTGTGATCAGTGATGTAGGGAGCTGGATTCTGTTTCTTGTTTCA...

XM_057938881.1
GGTCGTTGAATGCTATGCAAAGATATTTCTCCCCGGCATTAATATTTCTTTTATTTCTCGCCTCAAAATTGTATCAACTTGCAATGTGGATGTCCCTCTCCTCTTTTTGTTCTTCACTCATCCTTGTCTGGACCTGTGATCAGTGATGTAGGGAGCTGGATTCTGTTTCTTGTTTCAATTTTTTCCTTTTCTGGGGGAGGAGGGATCATTGTGCTGTGTCGAGTGCTTCTTCAACAAGGTTGCTGCACTTGATGTCGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011106
ATGGGTATCATAAGCACGATTTTGGGGGTTTTTGGGTTCGGGATAGGAATCGGCATTGGGGTTGTGATTGGATACTTTCTCTTCATCTACACTCAACCAACTGACGTCAAGGATCCTGAAATGCGTCCATTACTTGAGAAAGATAGTAAAAGCATTGAACAGCTGCTTCCAGAGATACCTTTTTGGATTAAAAATCCAGATTATGAGCGGATGGATTGGTTGAACAAATTCATAGAATATATGTGGCCTAGTTTAGACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057794864.1
MGIISTILGVFGFGIGIGIGVVIGYFLFIYTQPTDVKDPEMRPLLEKDSKSIEQLLPEIPFWIKNPDYERMDWLNKFIEYMWPSLDKAICKMAKKIAEPIIAEQIPKYKIDSVDFETLTLGCLPPTFQGMKVYNTEEKELIMELGLKWAANPNILVAAKAFGLRATVQVVDLQVFACPRITLKPLVPSFPCFANIYVSLMEKPHVDFGVKLLGADAMSIPGVYRLVQEIIKDQVANMYLWPKRLEVQIMDPSKAMKKPVG...

XP_057794865.1
MGIISTILGVFGFGIGIGIGVVIGYFLFIYTQPTDVKDPEMRPLLEKDSKSIEQLLPEIPFWIKNPDYERMDWLNKFIEYMWPSLDKAICKMAKKIAEPIIAEQIPKYKIDSVDFETLTLGCLPPTFQGMKVYNTEEKELIMELGLKWAANPNILVAAKAFGLRATVQVVDLQVFACPRITLKPLVPSFPCFANIYVSLMEKPHVDFGVKLLGADAMSIPGVYRLVQEIIKDQVANMYLWPKRLEVQIMDPSKAMKKPVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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