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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000815`

染色体: Chr02 坐标: 13643632-13649062 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000815`
名称	SmilChr02G000815
描述	putative BPI/LBP family protein At1g04970
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	13643632 - 13649062 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011282`
GeneID	`131011282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011282`
原始查询	`LOC131011282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative BPI/LBP family protein At1g04970
产物	putative BPI/LBP family protein At1g04970
Arabidopsis	`AT1G04970` (AT1G04970) lipid-binding serum glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839357] identity=49.2; qcov=0.918; evalue=5.76e-160; confidence=high
Rice	`Os09g0482720` - identity=45.7; qcov=0.934; evalue=1.13e-146; confidence=high
GO	GO:0005615 (GO:0005615); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	smil04620 (Toll-like receptor signaling pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01273 (LBP_BPI_CETP); PF02886 (LBP_BPI_CETP_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057795052.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057795052.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795052.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795052.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:13644141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:13645864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B140,B69
`Chr2:13645924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C12
`Chr2:13645940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr2:13646602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr2:13647246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:13648570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr2:13648636`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr2:13648636`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795052.1

485 aa

242

485

LBP_BPI_CETP

LBP_BPI_CETP_C

PF01273 LBP_BPI_CETP 37-208 aa PF02886 LBP_BPI_CETP_C 224-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795052.1`	Pfam	`PF01273`	LBP_BPI_CETP	Family	37	208	2.1e-23	83.6	LBP / BPI / CETP family, N-terminal domain
`XP_057795052.1`	Pfam	`PF02886`	LBP_BPI_CETP_C	Domain	224	472	6.7e-30	105.1	LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939069.1
TACTAAAATTATTCAACCGCATCAAACACGAGGCAAATCATCAAATTTTCAATCTTGATACAATTCCTAGAATATACTACTCTGCGTCAGCATCTCCAATCCACCAACTTCATCATCAACCAAATAATAGTAATTATTACTCGCCCAATTTGATTGGGAAGACTTAATTTATCAGGACTTACCTCAATCGATTCCATGGCGGACTTAATCCCTCCATTTCTATTGCTCCTTTTGTTCACATTTTCCTATAATTGTGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011282
ATGGCGGACTTAATCCCTCCATTTCTATTGCTCCTTTTGTTCACATTTTCCTATAATTGTGTTGAATCCATTGAGCAAGGGCATATCAACGCCGAAATATCGAACAGAGGGCTTGATTTCCTAAAGGAATTGCTGATTGAGAAGGCAGAGTTCGAATTAGTTCCGCTCGAGCTCCCCGAGATTGTGAAGTCCGTGAAAATTCCTATTATAGGTACTGTTCAGATGGCTGCTACCGGTATTACGATCGAAACAATCCACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795052.1
MADLIPPFLLLLLFTFSYNCVESIEQGHINAEISNRGLDFLKELLIEKAEFELVPLELPEIVKSVKIPIIGTVQMAATGITIETIHVTSSTLKSGDSGMVIDVSGATANLSMNWQYSYSTWLLPISVSDKGNATVQVEGLEVGLTLSLETVEGSLKVSLLECGCYVNGISIKLNGGASWLYQGLVDAFEDKISSAVEDAIPKKIKDAIVKLDNSLQSFPKEVSVTSIAALNVTLVGDPALNESSLDLKIDGLFSAKDEAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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