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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001174`

染色体: Chr02 坐标: 21550298-21552936 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001174`
名称	SmilChr02G001174
描述	autophagy-related protein 8C-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	21550298 - 21552936 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011556`
GeneID	`131011556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011556`
原始查询	`LOC131011556`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 8C-like
产物	autophagy-related protein 8C-like
Arabidopsis	`AT1G62040` (ATG8C) Ubiquitin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842499] identity=90.8; qcov=1; evalue=5.15e-79; confidence=high
Rice	`Os08g0191600` (OsATG8c) - identity=95.8; qcov=1; evalue=1.62e-81; confidence=high
GO	GO:0006995 (cellular response to nitrogen starvation)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02991 (ATG8); PF04110 (APG12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057795309.1`
2	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.80000	`XP_057795309.1`
3	Autophagosome	Autophagosome	0.80000	`XP_057795309.1`
4	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057795309.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057795309.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:21550578`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr2:21550578`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr2:21551713`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A2,A20,A25,A7,A9,B1,B10,B101,B106,B107,B111,B117,B118,B125,B130,B131,B133,B134,B138,B14,B140,B15,B2,B20,B21,B27,B35,B36,B37,B41,B44,B49,B58,B59,B62,B73,B76,B91,B94,B99,C17,C26,C29,C3,C31,C34,C4,C41,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C6,C60,C64,C66,C7,C76,C78,D1,D10,D8
`Chr2:21552702`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B111,B131,C1
`Chr2:21552702`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B111,B131,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795309.1

119 aa

119

ATG8

APG12

PF02991 ATG8 14-117 aa PF04110 APG12 40-117 aa

XP_057795310.1

119 aa

119

ATG8

APG12

PF02991 ATG8 14-117 aa PF04110 APG12 40-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795309.1`	Pfam	`PF02991`	ATG8	Domain	14	117	3.7e-52	175.6	Autophagy protein Atg8 ubiquitin like
`XP_057795309.1`	Pfam	`PF04110`	APG12	Domain	40	117	7.2e-06	27.1	Ubiquitin-like autophagy protein Apg12
`XP_057795310.1`	Pfam	`PF02991`	ATG8	Domain	14	117	3.7e-52	175.6	Autophagy protein Atg8 ubiquitin like
`XP_057795310.1`	Pfam	`PF04110`	APG12	Domain	40	117	7.2e-06	27.1	Ubiquitin-like autophagy protein Apg12

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939326.1
TTTTGGATAAATAAATATGAGAGAAGTAGTAGAAAGTATTGCTCCACAGTCTTCGTCTGTGTCGTATACGCAAATTCGATTGCCCTCGCCGACGCCATGGCTAAAAGCTCATTTAAGTTGGAACACCCTCTCGAGAGGCGACAGGCTGAAGCTGCTCGTATTAGGGAGAAGTACCCTGACAGAATCCCGGTTATTGTGGAGAAGGCTGAACGCAGTGACATTCCTGATATTGATAAGAAAAAGTATCTAGTTCCTGCTGA...

XM_057939327.1
ACAGTCTTCGTCTGTGTCGTATACGTAGGGTTCAAGTCTCTATTATTTTCGATTTTGCGCTCATTTATTTATTCCGTAAAGGGCAAATTCGATTGCCCTCGCCGACGCCATGGCTAAAAGCTCATTTAAGTTGGAACACCCTCTCGAGAGGCGACAGGCTGAAGCTGCTCGTATTAGGGAGAAGTACCCTGACAGAATCCCGGTTATTGTGGAGAAGGCTGAACGCAGTGACATTCCTGATATTGATAAGAAAAAGTATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131011556
ATGGCTAAAAGCTCATTTAAGTTGGAACACCCTCTCGAGAGGCGACAGGCTGAAGCTGCTCGTATTAGGGAGAAGTACCCTGACAGAATCCCGGTTATTGTGGAGAAGGCTGAACGCAGTGACATTCCTGATATTGATAAGAAAAAGTATCTAGTTCCTGCTGATCTTACTGTCGGGCAATTTGTATATGTTGTCCGCAAAAGAATTAAGCTCAGTGCTGAGAAAGCCATCTTTATCTTCGTCAAGAATGTGCTCCCTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057795309.1
MAKSSFKLEHPLERRQAEAARIREKYPDRIPVIVEKAERSDIPDIDKKKYLVPADLTVGQFVYVVRKRIKLSAEKAIFIFVKNVLPPTAAMMSAIYEENKDEDGFLYMTYSGENTFGLL

XP_057795310.1
MAKSSFKLEHPLERRQAEAARIREKYPDRIPVIVEKAERSDIPDIDKKKYLVPADLTVGQFVYVVRKRIKLSAEKAIFIFVKNVLPPTAAMMSAIYEENKDEDGFLYMTYSGENTFGLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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