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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002741`

染色体: Chr02 坐标: 47381010-47385361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002741`
名称	SmilChr02G002741
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	47381010 - 47385361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011774`
GeneID	`131011774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011774`
原始查询	`LOC131011774`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34; qcov=0.665; evalue=1.93e-105; confidence=low
Rice	`Os03g0181600` (OsGATA22) - identity=42.3; qcov=0.65; evalue=2.67e-158; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795600.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795600.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795600.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795600.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:47382644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B108,C23,C57,C74
`Chr2:47382784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:47382785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B1,B108,B131,B89
`Chr2:47382845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr2:47383007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C22,C34,C41
`Chr2:47383940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C16
`Chr2:47384109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:47384253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B54,C55
`Chr2:47384260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B123,B140,B24,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795600.1

866 aa

433

866

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 190-274 aa PF03101 FAR1 322-411 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 497-615 aa PF10551 MULE 532-626 aa PF04434 SWIM 812-846 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795600.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	190	274	3.2e-49	166.3	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057795600.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	322	411	3.2e-49	166.3	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057795600.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	497	615	7.5e-09	36.3	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057795600.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	532	626	4.1e-20	72.7	MULE transposase domain
`XP_057795600.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	812	846	0.00011	22.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939617.1
CTCTTCCATCTCTCTCCATCTGCACTCTATCTCGACAGATACACACACGCACAAATCTTCTTCACCTTCGGTGATTGTGAAGTCGCCGCCGTCGTCTTCCTGTTGAATTTGCCGGGCCTCCGTCGTAAGCCGCCGCCATCCCTTCGCCTCCCTCTATCTCCATCACTTTTACTCTCTCTCGTTCTCTCGACAATACACACAATAGCCCTAAATCCCCCCTCCCCATTCCCCTTTTTCGAACTTGCCGCTGCTGCTACGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011774
ATGGACTCTGGCCTTGGTTCTGGGGCAAGGGATAGTTCTGAGGATGACATTGTAGGGGTAGGTGATCCTACTGCAGTAGTGGATGCCTGTATAAATCAGATAGGTGAGGTTTCAAGCTTCCTGTATGATGATGAGGAGGTCTTTGTTCATGAAGATGCATCGTTGAGTCGCGAAGCTTCTTCTACTGAGAAAGATGGTATGGATGTAGATAGAGAGAGCACATATAGCTGCCTTAATTCTTCTTCATCAGAGGAAAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795600.1
MDSGLGSGARDSSEDDIVGVGDPTAVVDACINQIGEVSSFLYDDEEVFVHEDASLSREASSTEKDGMDVDRESTYSCLNSSSSEEKSFYSDGKHESASQNGCLNNDAECQSPKACISGNNGPDILGEQDDRSPGISSDDQLGMDADDKQVSIAETPSNASSGSIKDEAEEYIVPELGVEFESEEHAYKCYNRYALMEGFSIRKDFVNKSKVTGLVVSRRYTCHRQGYGSSKRDMNMKPRKETRTGCQAHMTITRQTNGKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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