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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000579`

染色体: Chr02 坐标: 8321882-8327515 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000579`
名称	SmilChr02G000579
描述	autophagy-related protein 13b
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8321882 - 8327515 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012919`
GeneID	`131012919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012919`
原始查询	`LOC131012919`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 13b
产物	autophagy-related protein 13b
Arabidopsis	`AT3G18770` (AT3G18770) Autophagy-related protein 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821408] identity=45.4; qcov=0.979; evalue=3.58e-97; confidence=high
Rice	`Os11g0162000` - identity=33.7; qcov=0.985; evalue=2.87e-53; confidence=low
GO	GO:0000045 (autophagosome assembly); GO:0000407 (phagophore assembly site); GO:0000423 (mitophagy); GO:0005829 (cytosol); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0034497 (protein localization to phagophore assembly site); GO:0034727 (piecemeal microautophagy of the nucleus); GO:1990316 (Atg1/ULK1 kinase complex)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10033 (ATG13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796872.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057796873.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796873.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057796872.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057796872.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8322307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8325505`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	134	A10,A14,A15,A18,A2,A22,A25,A4,A5,A6,B1,B10,B105,B106,B11,B110,B115,B118,B12,B120,B122,B124,B125,B126,B129,B13,B130,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B17,B19,B2,B21,B24,B25,B26,B27,B29,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B4,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B57,B59,B60,B61,B62,B65,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B77,B78,B80,B84,B86,B87,B88,B91,B92,B93,B95,B97,B98,C12,C14,C16,C17,C18,C2,C23,C24,C25,C26,C29,C30,C31,C32,C35,C36,C38,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C53,C55,C56,C57,C6,C62,C63,C64,C66,C68,C70,C71,C72,C73,C78,C8,C85,C87,D1,D2,D3,D6,D9
`Chr2:8326270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr2:8326274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B19,B32,C4
`Chr2:8326664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796872.1

622 aa

311

622

ATG13

PF10033 ATG13 19-261 aa

XP_057796873.1

527 aa

264

527

ATG13

PF10033 ATG13 44-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796872.1`	Pfam	`PF10033`	ATG13	Family	19	261	1.7e-41	143.2	Autophagy-related protein 13
`XP_057796873.1`	Pfam	`PF10033`	ATG13	Family	44	166	2.4e-24	87.0	Autophagy-related protein 13

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940889.1
AACCTAAAATCCAAATCAAAATCGGAAACCTTTTTACCCTTTCCTTTTCTTCTAGAAAAACTTGATCAACTTCTCCTCCTTCTTCATCGTCTCCTTATCCAAGTCTTGCTCATCTGCAAGTAAACCGCAGCACTATACACTTATGAGTTTAGGGCAATTCTCTTCATCTGCATAAACATAAGGTGTCATATAAAGAAGCCGCAGTGACATGAACGGACGTAAATACCCTCAAAGCCCCTTTTGAGTTCTTTACAAGCAAT...

XM_057940890.1
AATCAAAATCGGAAACCTTTTTACCCTTTCCTTTTCTTCTAGAAAAACTTGATCAACTTCTCCTCCTTCTTCATCGTCTCCTTATCCAAGTCTTGCTCATCTGCAAGTAAACCGCAGCACTATACACTTATGAGTTTAGGGCAATTCTCTTCATCTGCATAAACATAAGGTGTCATATAAAGAAGCCGCAGTGACATGAACGGACGTAAATACCCTCAAAGCCCCTTTTGAGTTCTTTACAAGCAATCCATTGAAGCAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012919
ATGGCTTCTTATCACGGTAACTCTCATTCGGAACGTGCCAAAATGGAACAGATAATCACAGAGTTTTTTGCGAAAAGCCTTCACATAATACTCGAGTCGCGTTGCCCTTACGTCTCTTCGCGTAATTACAGCGGGGAGCAGGTTTTGTCCTCGCCGTCTCCGTCTTCTTCTTCGTCGTCGTCTTCGAGTGTTAGGCCTCGGGATAAGTGGTTTAATCTAGCGCTGAGGGATTGCCCTGCTGCCTTAGAGAACATAGATTT...

LOC131012919
ATGATAGTTGATGTTATACTTATGCAGAGGCCCATTGATTGGGATCCTTTGAATTTCTCCCCTAAAACAGGCTTTGGGTGGAATTCATCGGGGAAGGAGCGGCACTACTATGGCTCGGATAATGAGGAATTTGGGTGTGAAGGGAAAAATGAGAGGATTATTGAGAGATGGGTTCTGCAATATGAGAGTAAGAAGAATGGTGGTGGCTCTTCTGGGAGTAAGAAGAGGTCGAATTGTACGAGCTCTCATGCTTTGTACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796872.1
MASYHGNSHSERAKMEQIITEFFAKSLHIILESRCPYVSSRNYSGEQVLSSPSPSSSSSSSSSVRPRDKWFNLALRDCPAALENIDFWRQSNLEPMIVDVILMQRPIDWDPLNFSPKTGFGWNSSGKERHYYGSDNEEFGCEGKNERIIERWVLQYESKKNGGGSSGSKKRSNCTSSHALYKKSILLLRSLYATVRLLPAYKLFRDLTSSAQIRLYNLGHRVSSFVEPFTRREEADMQRFVFTPVDTSCGRLCLSVLYRS...

XP_057796873.1
MIVDVILMQRPIDWDPLNFSPKTGFGWNSSGKERHYYGSDNEEFGCEGKNERIIERWVLQYESKKNGGGSSGSKKRSNCTSSHALYKKSILLLRSLYATVRLLPAYKLFRDLTSSAQIRLYNLGHRVSSFVEPFTRREEADMQRFVFTPVDTSCGRLCLSVLYRSSVVDMSSDPSTPISPQFIPEYVGSPMAEPLKRFPSGFVSQGSPSSSPFGRRHSWSYDLYRASPPSANPSPSPSPTYSDSHASLAKQRCRRLPPPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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