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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004245`

染色体: Chr02 坐标: 64645941-64648038 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004245`
名称	SmilChr02G004245
描述	glutathione S-transferase-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64645941 - 64648038 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013015`
GeneID	`131013015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013015`
原始查询	`LOC131013015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase-like
产物	glutathione S-transferase-like
Arabidopsis	`AT2G47730` (GSTF8) glutathione S-transferase phi 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819386] identity=46.5; qcov=0.942; evalue=1.27e-65; confidence=high
Rice	`Os03g0135300` (OsGSTF3) - identity=58; qcov=1.01; evalue=8.86e-92; confidence=high
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0043295 (glutathione binding)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00043 (GST_C); PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13410 (GST_C_2); PF13417 (GST_N_3); PF14497 (GST_C_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796998.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796998.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796998.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796998.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64646202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C25
`Chr2:64646258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D8
`Chr2:64646371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:64647522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64647591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B36,B46
`Chr2:64647756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B9,C2,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796998.1

224 aa

112

224

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C

GST_C_2

GST_C_3

PF02798 GST_N 4-78 aa PF13417 GST_N_3 8-84 aa PF13409 GST_N_2 12-80 aa PF00043 GST_C 124-207 aa PF13410 GST_C_2 138-199 aa PF14497 GST_C_3 140-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	4	78	3.4e-17	63.2	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	8	84	1.7e-11	45.0	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	12	80	6.6e-13	49.8	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF00043`	GST_C	Domain	124	207	2.6e-13	50.7	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	138	199	2.9e-06	28.0	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057796998.1`	Pfam	`PF14497`	GST_C_3	Domain	140	210	5.4e-06	27.3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941015.1
GGGTCCGACCCGCACGTACGGTGTGCCTCCGTGCCGCCCCAAATTTAAATGCATCATTATTATTCTGGGAAAAGTGAAATTAAATAAGAAATAAATGAGAGGTGGTCGCTCTGGAAACCACCTCATCTCAATGGTACATTATTGAAAAATTAAAGAAACTGAAAATATAGAGATATATAGAGAGAGTAAATCTGTGAACTGAAGAATGGCGGCGCCGGTGAAAGTGTACGGTCCTCCGTTCTCCACCGCCGTGGCAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013015
ATGGCGGCGCCGGTGAAAGTGTACGGTCCTCCGTTCTCCACCGCCGTGGCAAGGGTGATGGTGACTCTCATCGAGAAAGATGTCCCATTTCAGCTCCTCCCTGTTAACATGGCCAAAGCTGAACACAAGAAGCCCGACTACCTCAAGCTTCAGCCATTTGGACAAGTACCAGCATTTCAAGATGGGGATGGGAGCATTACTATCTTCGAATCCAGAGCCATATCAAGATACGTTTGTGATAAATATGCAAACCAAGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796998.1
MAAPVKVYGPPFSTAVARVMVTLIEKDVPFQLLPVNMAKAEHKKPDYLKLQPFGQVPAFQDGDGSITIFESRAISRYVCDKYANQGNKGLFGTNPLEKASIDQWLEAEGQNFSPPSSILVFQLTFAPRMKIKQDQNLIKQNEAKLARVLDVYDKRLNESRYLAGDDFTLADLSHLPNAHYLNGTDVGELFRSRKNVERWWAEVSSRESWKKVVEMQRSPAPTTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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