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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001997`

染色体: Chr03 坐标: 29653235-29657533 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001997`
名称	SmilChr03G001997
描述	chloroplast processing peptidase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	29653235 - 29657533 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014034`
GeneID	`131014034`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014034`
原始查询	`LOC131014034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloroplast processing peptidase-like
产物	chloroplast processing peptidase-like
Arabidopsis	`AT3G24590` (PLSP1) plastidic type i signal peptidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822055] identity=81.1; qcov=0.651; evalue=1.86e-118; confidence=high
Rice	`Os02g0267000` - identity=82.7; qcov=0.595; evalue=1.34e-109; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006465 (GO:0006465); GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0010027 (thylakoid membrane organization)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10502 (Peptidase_S26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014034

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797943.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057797943.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057797943.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057797943.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:29653455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C58,C85
`Chr3:29653573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr3:29653580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,B98,C50
`Chr3:29653772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C50
`Chr3:29654874`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C23
`Chr3:29654874`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C23
`Chr3:29657169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797943.1

301 aa

150

301

Peptidase_S26

PF10502 Peptidase_S26 119-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797943.1`	Pfam	`PF10502`	Peptidase_S26	Domain	119	275	2.4e-43	148.7	Signal peptidase, peptidase S26

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941960.1
ATTCCCGGTTAAGTTTTAATCACTTAGGCGCTGCAGCTACAAGGTTGCTCCTAAGTCTTAACGGCCAAATCAATTTCTTGTGCTTTCAATTTTGAACTCAACAGTCAATCGAGAGAGGGAGAGGCGAAATCAAAATCAGATGATACCTCTACAGCTTCGTTTACTTCCTAAGCCCCCTTTCTCCGAGAATCCTAACCTCTCCCGCACCACCAATTTCGACCACTCACACCCCATCTATATCAATGGCGCCCATTCTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014034
ATGATACCTCTACAGCTTCGTTTACTTCCTAAGCCCCCTTTCTCCGAGAATCCTAACCTCTCCCGCACCACCAATTTCGACCACTCACACCCCATCTATATCAATGGCGCCCATTCTCAATCTCTCTCATTCAAACCCCCCAACTGCTCTTCTTCCAACCGTAAAAGGGCTCGGTCGCAGCCCCTCCGTTGTAATGGGTCCGATAAGGAGACTGCGAAAACTACGGCCTTGAACACCAAAGAAAGCAGCGGCGGCGGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797943.1
MIPLQLRLLPKPPFSENPNLSRTTNFDHSHPIYINGAHSQSLSFKPPNCSSSNRKRARSQPLRCNGSDKETAKTTALNTKESSGGGGGGGGGDNGDGGETEESGGLLPEWLNFSSDDAKTVIAAFAISLAFRSFVAEPRYIPSLSMYPTFDVGDRIVAEKVSYYFRKPCPNDVVIFKSPPVLQEVGYTDEDVFIKRIVAKEGDTVEVHDGKLIVNGVVRNEDYILEAPKYEMTQTRVPENSVFVMGDNRNNSYDSHVWGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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