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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003735`

染色体: Chr03 坐标: 56380865-56382054 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003735`
名称	SmilChr03G003735
描述	acidic endochitinase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56380865 - 56382054 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014598`
GeneID	`131014598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014598`
原始查询	`LOC131014598`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acidic endochitinase
产物	acidic endochitinase
Arabidopsis	`AT5G24090` (CHIA) chitinase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832474] identity=67; qcov=0.993; evalue=1.85e-153; confidence=high
Rice	`Os01g0860500` (C10501) - identity=62.3; qcov=0.923; evalue=3.51e-125; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00704 (Glyco_hydro_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057798598.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057798598.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798598.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798598.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798598.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56381090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D8
`Chr3:56381207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr3:56381257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:56381324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:56381438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:56381495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B79,C54,C58,C85
`Chr3:56381562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:56381591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C54
`Chr3:56381665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr3:56381732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:56381832`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr3:56381832`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798598.1

299 aa

150

299

Glyco_hydro_18

PF00704 Glyco_hydro_18 28-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798598.1`	Pfam	`PF00704`	Glyco_hydro_18	Domain	28	247	5.2e-20	73.1	Glycosyl hydrolases family 18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942615.1
AGTTTACTTTTATATTACTTGTAGATTATAAAAAAATATCCTAAAGAGTAAAATACTAAAGTTTTCAACCCATCTTATAACTTATTTCTATAAATAACATACCTTAACTAAATGTATACTCGCATAAATCAAACATAATGGAAAGTAGACGCCAATTCCTATCTCCACTCCTCCTCCTCCTCTTCCAAGCCCTCCTCCGCACCTCAGCGAGAGGCGGCATCGCCGTCTACTGGGGCCAAAACGGTAACGAAGGCACTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014598
ATGGAAAGTAGACGCCAATTCCTATCTCCACTCCTCCTCCTCCTCTTCCAAGCCCTCCTCCGCACCTCAGCGAGAGGCGGCATCGCCGTCTACTGGGGCCAAAACGGTAACGAAGGCACTCTCGCCGACACCTGCGCCACCGGCAGATTCGCCTACATCAACATCGCCTTCCTCAACAAATTCGGCGGCGGCCAAACCCCCGAACTCAACCTCGCCGGCCACTGCAACCCCGCCACTAACTCCTGCCGCGTCGTCAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798598.1
MESRRQFLSPLLLLLFQALLRTSARGGIAVYWGQNGNEGTLADTCATGRFAYINIAFLNKFGGGQTPELNLAGHCNPATNSCRVVSDGIRACQSRGIKVMLSIGGGIGNYSLSSRDDARAFSVYLWNNFLGGGGSASRPLGDAVLDGVDLDIELGSPLHYDDLVKYLKRLGKHGRKVYVTGAPQCPFPDRLMGAALNTSLFDYVWVQFYNNPPCQYTSGNPKNLENSWMRWTRSVKAGKIFLGLPAAPQAAGSGFIPADV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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