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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003743`

染色体: Chr03 坐标: 56474785-56481308 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003743`
名称	SmilChr03G003743
描述	probable inactive receptor kinase At5g53320
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	56474785 - 56481308 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014607`
GeneID	`131014607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014607`
原始查询	`LOC131014607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive receptor kinase At5g53320
产物	probable inactive receptor kinase At5g53320
Arabidopsis	`AT5G53320` (AT5G53320) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835413] identity=35.9; qcov=0.684; evalue=4.08e-43; confidence=medium
Rice	`Os01g0223600` - identity=36.9; qcov=0.797; evalue=3.01e-46; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057798617.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057798617.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057798617.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798617.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798617.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:56475150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:56475155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B12,C9
`Chr3:56475155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C9
`Chr3:56475159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B35,B47,B55,B94
`Chr3:56475173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C2
`Chr3:56475190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C2,C35
`Chr3:56475190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C35
`Chr3:56475231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C18,C20
`Chr3:56475264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C21
`Chr3:56475280`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,B51,B76,B84,C15
`Chr3:56475280`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A2,B51,B76,B84,C15
`Chr3:56475309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798617.1

374 aa

187

374

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 90-326 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 92-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798617.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	90	326	6.7e-13	49.3	Protein kinase domain
`XP_057798617.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	92	215	1.6e-16	61.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942634.1
TCAACAATCTGAATGTTACCGACAGAAACTTATTTTACTTAAAATTTTGTTTTGTTTTTACTCTCATAAATTTATTCCACAGAATTATGATTTATTGTGAATACATATTATCGTGTTTGTATTACTTTGATTTAAGAGAAATATATTATGATTCCTCCTTTTAGCCGTGGAGACTGGTTAGCGACCCTTGGGTGTTTACAAATATATACTAATTCAACTTCTGCTACTTCTGAGAAACTACTGAATAAACGCGTTGGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014607
ATGTCTAGGAATTACGACAACTGGGAGAGGCTGGTGGCGGCGGTGGTGAAGAGAGAGCAGATTTGGCAACTCTGTCATCAAGATTCTATCTCCACCATCTGCGCCTCTGACTACTCATCAGATCTGGAATTGGGTTTGCCCCTTTCACTTGGGAGCTTCCACATTGCTGCAACTTTCGAGTTGGTTCAACACCTCAACTACGGGAAAACGGATCTGGTTCGGCTGTTGCGGGATGTGCAGGTGTCGGACCAGCAATGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798617.1
MSRNYDNWERLVAAVVKREQIWQLCHQDSISTICASDYSSDLELGLPLSLGSFHIAATFELVQHLNYGKTDLVRLLRDVQVSDQQCFRSGSRAVIKLMDTASITEYEFEQHMIVLRDCKHENVGTPWAYHLSEERKLMVYDYYSQGSVFDMFRGNGSRPDWESRVRIAVGAARGIEHIHAQCGGKLVHGNIKSSNIFVNSQEYGCVSDICLGEMAHHYASKQELRKSDVYSFGMLLLELVIGRSLVHSPYIVRRLRLSDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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