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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003832`

染色体: Chr03 坐标: 57463392-57468826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003832`
名称	SmilChr03G003832
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 34
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	57463392 - 57468826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014695`
GeneID	`131014695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014695`
原始查询	`LOC131014695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 34
产物	probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 34
Arabidopsis	`AT3G49220` (AT3G49220) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824083] identity=65.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0288100` (OsPME8) - identity=55.6; qcov=0.731; evalue=6.35e-172; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798730.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057798730.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798730.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798730.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:57463601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:57463602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr3:57463646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B105,B131
`Chr3:57463783`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A19,A22,B11,B112,B114,B119,B122,B125,B17,B47,B5,B73,B76,B8,C20,C24,C38,C50,C52,D3
`Chr3:57463805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:57463840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C20
`Chr3:57463847`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A19,A22,B108,B11,B112,B114,B119,B122,B17,B47,B73,B76,B81,C20,C30,C38,D3
`Chr3:57463952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:57464003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:57464221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B136,C38,C8
`Chr3:57464274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B37,B63,B89
`Chr3:57465089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798730.1

595 aa

298

595

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 80-227 aa PF01095 Pectinesterase 281-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798730.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	80	227	1.1e-36	127.1	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057798730.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	281	578	4e-145	482.9	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942747.1
CTACCAATATAGTGCTGCTAAGTAGAATCCAGCTAATTCCCTCGGACAGTTGGACATCATCCATTCCCCACCCCCTCTCCTCTTTCTCACTCATCATATATACACGCTGCGGCAGGGTCCATATATCTTTAACCACTAACTCCTTCACTCCTCTTCCTACCATCACTCACATTCTCACTTCAAATGGAATACGGCAGGCTCGGACCACCCGAACCTACCAGCGGTGGCTCCTCAACTCATAGCCTAACCCCGGACCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014695
ATGGAATACGGCAGGCTCGGACCACCCGAACCTACCAGCGGTGGCTCCTCAACTCATAGCCTAACCCCGGACCCCACCCGCGCCCCCAGAAAATCCAGACTCAAGCTCCTCCTCGTCCTCGCCGCCACGCTCATAGCAGCGTCCGCAGTCGCCGCCGCCCTCGTCGTCGTCGTCGTCCGCAACAGAGTTGACGATTCCGGCGGCGCCTCCGCGATGCATGCTCGCCGCCCCTCCAAGGCCGTCTCCCAAGCCTGCGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798730.1
MEYGRLGPPEPTSGGSSTHSLTPDPTRAPRKSRLKLLLVLAATLIAASAVAAALVVVVVRNRVDDSGGASAMHARRPSKAVSQACGKTRYPNLCVNSLLDFPGADSASAKDLVHISVNMTLRKFGRALYSAAEISNLNMYPHVRSAYDDCLELLDDSVDLLSRSLTTVAPGRGGGGSTQDVLTWLSASLTNQDTCTDGFAELNGYVKNQMMERLKDLSELVSNCLAIYAAAAGDEDFSGIPIQNRRRRLLGNEKAHRHFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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