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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003962`

染色体: Chr03 坐标: 58658477-58663705 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003962`
名称	SmilChr03G003962
描述	glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	58658477 - 58663705 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014818`
GeneID	`131014818`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014818`
原始查询	`LOC131014818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6, mitochondrial
产物	glycerol-3-phosphate dehydrogenase SDP6%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G10370` (SDP6) FAD-dependent oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820199] identity=82.2; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0224900` - identity=78.4; qcov=0.598; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0004368 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase (quinone) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006072 (glycerol-3-phosphate metabolic process); GO:0009331 (glycerol-3-phosphate dehydrogenase (FAD) complex)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF16901 (DAO_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014818

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057798898.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057798898.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057798898.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798898.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:58658983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B101
`Chr3:58659435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B35,C23
`Chr3:58661136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:58661724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:58663269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B47,C53,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798898.1

627 aa

314

627

FAD_binding_2

DAO

DAO_C

PF00890 FAD_binding_2 73-113 aa PF01266 DAO 73-441 aa PF16901 DAO_C 463-598 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798898.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	73	113	9.4e-06	25.8	FAD binding domain
`XP_057798898.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	73	441	6.2e-57	194.4	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057798898.1`	Pfam	`PF16901`	DAO_C	Family	463	598	6.9e-37	126.9	C-terminal domain of alpha-glycerophosphate oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057942915.1
GCAGAAGGTATAGCACCATCCCCATTATAATATAAAGTATATTCTATTCGCAATTTCAAGACAGTATATGTTAAAGTTGAGTCCCATAACTGAATCAATCCATTTTTCTTCTTCCCATACTCTGATCCTACACCTCGCACTCGCACAATTTCCAGTATTCTGATCGCAAATTCCCCCTCATCCTCATGGCAGCCTCCATACGCCTCCGACGTCTCGGCGCCGTCGCCGCCGTCGCCGGCGGTGCCTACTTCACCGTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014818
ATGGCAGCCTCCATACGCCTCCGACGTCTCGGCGCCGTCGCCGCCGTCGCCGGCGGTGCCTACTTCACCGTCCTCAGCAACCCTCAAATCGCCGCCAGCGACCGCGCTCCCGCCCTCACCAATGTCAAGCAGAGAATCGCGGACCCCTTCGCCGCCGTGCCGTCGCGCGCCGTCCAGGAGTCCGCCTTGATCGGCTCCAGCGCCGCTAACCCCCTCGACATCCTCGTCATCGGCGGCGGGGCCACCGGCTGCGGGGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798898.1
MAASIRLRRLGAVAAVAGGAYFTVLSNPQIAASDRAPALTNVKQRIADPFAAVPSRAVQESALIGSSAANPLDILVIGGGATGCGVALDAATRGLRVGLVEREDFASGTSSRSTKLIHGGVRYLEKAVFNLDYGQLKLVFHALEERKQVIENAPHLCNALPCMTPCFSWFEAVYYWMGLKMYDLVAGRHLLHLSRYYSAQESVELFPTLARKGNDRSLKGTVVYYDGQMNDSRLNVALACTAALAGAAVVNHAEVISFIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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