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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004042`

染色体: Chr03 坐标: 59419441-59422144 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004042`
名称	SmilChr03G004042
描述	probable adenylate kinase 6, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59419441 - 59422144 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014936`
GeneID	`131014936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014936`
原始查询	`LOC131014936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable adenylate kinase 6, chloroplastic
产物	probable adenylate kinase 6%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G37250` (ADK) adenosine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818302] identity=66.2; qcov=1; evalue=4.9e-133; confidence=high
Rice	`Os03g0130400` - identity=74; qcov=0.848; evalue=5.98e-134; confidence=high
GO	GO:0004017 (AMP kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00406 (ADK); PF13207 (AAA_17); PF13238 (AAA_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799101.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057799101.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799101.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799101.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59419762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B118,B128
`Chr3:59420314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C38
`Chr3:59420422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:59420508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B76,D3
`Chr3:59421602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:59421659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799101.1

277 aa

138

277

AAA_17

AAA_18

ADK

PF13207 AAA_17 50-170 aa PF13238 AAA_18 50-170 aa PF00406 ADK 50-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799101.1`	Pfam	`PF13207`	AAA_17	Domain	50	170	2.9e-22	80.2	AAA domain
`XP_057799101.1`	Pfam	`PF13238`	AAA_18	Domain	50	170	8.2e-08	33.5	AAA domain
`XP_057799101.1`	Pfam	`PF00406`	ADK	Domain	50	241	1e-39	136.8	Adenylate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943118.1
TTTGATTTATGGAATTGAAGTTAGACGTCTGAATTAAAGGTATATTTCACATTAGTTTTAATTTACAAAAATAAGCATTAAATATTACATTAAATATCATAACACTTTTTTAAAATAAAAGAAAGAGAGTTGAGGTAGAAATAGAAATTTCGAAATAAAAAGAAAATGAGAAAAAGTAAAGAGTTAGAACCCCACGTGTTTTCTGAATTCCGCCCGTGCCTCAATTCGGTCGCTTCCCTTCGTCAACCTCCTCTCCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014936
ATGGCGGTATTCAGCCGCCTTATGTGCAGAGCCGCCTCAGCTCGAAGTTTCTGCACGAAATCTACGACGGCTGACCGACACCTACTCTCTTCGTCCCTGCCCCTCAATAATTCCACGGGCAAGGGCAGAAACGTTCAGTGGGTCTTCCTTGGCTGCCCGGGCGTCGGCAAGGGCACCTACGCTGCCCGCCTCTCCAAGCTCCTCGGCGTGCCCCACATCGCCACCGGCGATCTCGTCCGCCACGAGCTCTCTTCCTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799101.1
MAVFSRLMCRAASARSFCTKSTTADRHLLSSSLPLNNSTGKGRNVQWVFLGCPGVGKGTYAARLSKLLGVPHIATGDLVRHELSSSGPLSSQLAEIVNQGKLISDEIVIDLLSKRLEQAQAKGETGFILDGFPRTVRQAEILEEVTDIDLVINLKLREEALIAKCLGRRTCSECGGNYNVACIDIKGEDGNPRMYMPPLLPPPHCESKLITRSDDNEEVVKERLRVYNELSRPVEDFYRLRGRLLEFDLPGGIPESWTKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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