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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004139`

染色体: Chr03 坐标: 60235348-60237370 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004139`
名称	SmilChr03G004139
描述	glutamate receptor 2.7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60235348 - 60237370 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015007`
GeneID	`131015007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015007`
原始查询	`LOC131015007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate receptor 2.7-like
产物	glutamate receptor 2.7-like
Arabidopsis	`AT2G29120` (GLR2.7) glutamate receptor 2.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817460] identity=49.7; qcov=0.612; evalue=8.05e-50; confidence=medium
Rice	`Os09g0431200` (OsGLR1.1) - identity=51.3; qcov=0.666; evalue=2.48e-54; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015276 (ligand-gated monoatomic ion channel activity); GO:0038023 (signaling receptor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00060 (Lig_chan)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799184.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799184.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799184.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799184.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60235839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B20,B65
`Chr3:60235864`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A15,A22,A24,A4,B104,B105,B113,B118,B120,B139,B21,B3,B30,B31,B34,B4,B45,B53,B54,B69,B76,B78,B8,B88,B90,B92,B94,C1,C11,C13,C17,C19,C23,C25,C26,C27,C33,C38,C41,C6,C61,C69,C74,C84,D5
`Chr3:60235888`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B6,C67,C8
`Chr3:60235888`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B6,C67,C8
`Chr3:60235890`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A5,A7,A8,B102,B12,B124,B125,B136,B138,B20,B23,B32,B41,B51,B55,B59,B6,B61,B63,B71,B80,B81,B86,B92,C1,C12,C16,C19,C21,C3,C30,C4,C46,C49,C53,C54,C57,C63,C67,C7,C70,C73,C78,C81,C87,D8
`Chr3:60235892`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B6,C67,C8
`Chr3:60235892`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B6,C67,C8
`Chr3:60235931`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	107	A18,A2,A21,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B1,B101,B102,B11,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B131,B132,B134,B136,B138,B140,B20,B23,B24,B25,B32,B33,B34,B37,B41,B46,B51,B52,B54,B55,B59,B6,B61,B63,B69,B7,B71,B72,B74,B75,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B87,B90,B92,B95,C1,C10,C11,C12,C13,C16,C19,C21,C24,C3,C30,C32,C33,C36,C4,C40,C46,C47,C48,C49,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C73,C78,C80,C81,C84,C87,D1,D10,D11,D8
`Chr3:60235956`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	72	A18,A19,A2,A21,A24,A25,A5,A6,A8,B1,B101,B107,B11,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B123,B124,B126,B127,B131,B132,B134,B140,B20,B24,B25,B33,B34,B37,B46,B51,B52,B54,B69,B7,B72,B74,B75,B8,B84,B85,B87,B90,B92,B95,C10,C11,C13,C19,C24,C3,C33,C36,C40,C47,C48,C51,C54,C55,C57,C58,C68,C69,C80,C84,D1,D10,D11
`Chr3:60235979`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	116	A19,A21,A23,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B104,B105,B106,B111,B115,B117,B118,B12,B121,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B136,B137,B139,B140,B15,B23,B25,B28,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B41,B42,B5,B51,B52,B54,B55,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B68,B7,B74,B77,B8,B80,B81,B85,B86,B9,B90,B93,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C21,C22,C24,C28,C3,C30,C31,C36,C4,C40,C42,C43,C46,C51,C53,C55,C58,C60,C63,C64,C66,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D8
`Chr3:60235982`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	117	A19,A21,A23,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B104,B105,B106,B111,B115,B117,B118,B12,B121,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B136,B137,B139,B140,B15,B23,B25,B28,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B39,B41,B42,B5,B51,B52,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B68,B7,B74,B77,B8,B80,B81,B85,B86,B9,B90,B93,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C21,C22,C24,C28,C3,C30,C31,C36,C4,C40,C42,C43,C46,C51,C53,C55,C58,C60,C63,C64,C66,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C77,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D8
`Chr3:60236168`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A19,A24,B118,B127,B131,B132,B34,B52,B75,B85,B89,C12,C24,C33,C4,C40,C51,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799184.1

299 aa

150

299

Lig_chan

PF00060 Lig_chan 179-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799184.1`	Pfam	`PF00060`	Lig_chan	Family	179	284	1.4e-15	58.1	Ligand-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943201.1
AGCAGTTAAATTTACAAATCCAATTTATTCAAACAAGCTAAGACTGCTGACTTTTGACATAAAAAAATATTTAATGATACTCGTTCCAAAATTCTTATGCACATAACTAGAAATTTTCATCTAACTTCCTTTTGTTAAATACTAGTATAAAACTGGTAAAAGCTGCCCAAATAATCACCAACATCAAAATTCTCTGATAACTTTAGCACATAATGAAGTTGGAGGCTCCAATGGTAGCCGTTTTTCCTCTTCTTGTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015007
ATGAAGTTGGAGGCTCCAATGGTAGCCGTTTTTCCTCTTCTTGTTTGTATTCTCTTGATGAATACCTTCTCCATGAATTTCACCACAGCACAGAGCACACCTTTCCCTGCCAGAGTTGGAGTGGTGGTAGACATGGACAGTGACGTCGGCAAAATGAGGTTGAGCTGCATCGAAATGGCAATCTCGGATTACTACACCAGACATGGCTACTACCAGACTAAGCTGGTTCTCGACAAGAGAGATGTTGTCGGGGCAGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799184.1
MKLEAPMVAVFPLLVCILLMNTFSMNFTTAQSTPFPARVGVVVDMDSDVGKMRLSCIEMAISDYYTRHGYYQTKLVLDKRDVVGAAAAAVVNHISYLNVQCNLEIHDEIVARSDRKKADTYDELLYAVHQGKFDAAVGDVTILANRSQYVNFTLPYTEAGISSNKTKNACVLLKPQPLTWKLWLICFCSFIFMGFLIWILELWINEDFRGPLWHQVGTIFLFASSTKLISNLSRLLLIIWLLVVLILTLSYAASLTSILT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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