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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004211`

染色体: Chr03 坐标: 60713264-60715929 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004211`
名称	SmilChr03G004211
描述	peroxidase 18-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60713264 - 60715929 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015088`
GeneID	`131015088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015088`
原始查询	`LOC131015088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 18-like
产物	peroxidase 18-like
Arabidopsis	`AT2G24800` (AT2G24800) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817017] identity=64.1; qcov=0.914; evalue=2.84e-142; confidence=high
Rice	`Os04g0498700` - identity=55.9; qcov=0.911; evalue=5.48e-119; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057799305.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057799305.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057799305.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799305.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60713486`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A19,B101,B126,B27,B52,B66,B75,B9,C15,C27,C30,C54,C59,C8,D2
`Chr3:60713521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B85
`Chr3:60713535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B97,C19,C55
`Chr3:60713538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:60713597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B84
`Chr3:60713631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B97,C19,C55
`Chr3:60713639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B44,B84
`Chr3:60713676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C62,C67
`Chr3:60713747`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B140,B73
`Chr3:60713747`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B140,B73
`Chr3:60713780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,C48,C6,C8
`Chr3:60714786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799305.1

326 aa

163

326

peroxidase

PF00141 peroxidase 43-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799305.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	43	289	4.8e-78	262.9	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943322.1
TTGAACCAAGAGCAGTTAATTGGAAGCTGAAATTGAATCCTTCAAATTCAATGATCTGGGGTCTGAATTTGCAATATGCATGATGATCCTGGTGTATTTATGTATTTTCTGACATTGTACTAAATATATGTACAGTATCCTTCCAACTCCCACCTACTTGAACTATTTCAATTTCCCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTACAAATAAATGAACAGATGCAGGAAGGAAAAGCATTTACTGAGTGTTTGTCACTGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015088
ATGGATTATTCATACAAATTGTTGATGCTTCTTTCTTCTCTCACTCTATGCCTCCTTCCATTTTCTTCTTGCTTGGCTCCCTCTGTCGGTTTCTACGCAGGTTCCTGTCCCGCAGCTGAACTCATGGTGAAGAACACCGTGAGATCAGCTTCTGATTTGGACCCCACAATCCCCGGGAAGCTCCTTCGCTTGCTCTTCCACGACTGCTTCATCGAGGGATGTGATGCTTCCATACTATTACAAGGAAACGGGACGGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799305.1
MDYSYKLLMLLSSLTLCLLPFSSCLAPSVGFYAGSCPAAELMVKNTVRSASDLDPTIPGKLLRLLFHDCFIEGCDASILLQGNGTERSDPANRSVDGFAVIDSAKRLLEIFCPETVSCADILAMAARDAVEYTGGPSVQIPTGRRDGRISAAANVRPNIIDTSFTLDEMAKLFIAKGLSMDDLVTLSGGHTIGKSHCSSFNDRFKLDPSGNVTVIDSSLDREYAIQLTKMCPAGARDDSITVNNDPGTPFQFDNEYYKIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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