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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004234`

染色体: Chr03 坐标: 60858870-60861165 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004234`
名称	SmilChr03G004234
描述	ferruginol synthase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60858870 - 60861165 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015108`
GeneID	`131015108`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015108`
原始查询	`LOC131015108`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`CYP76AH1` P002; 2013	`JX422213`	`LOC131015108` `SmilChr03G004234` GeneID 131015108	nucleotide; identity 99.194%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferruginol synthase-like
产物	ferruginol synthase-like
Arabidopsis	`AT2G45560` (CYP76C1) cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819164] identity=41.9; qcov=1.01; evalue=2.13e-145; confidence=medium
Rice	`Os03g0248200` - identity=44.3; qcov=0.962; evalue=2.01e-156; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015108

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799342.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057799342.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799342.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799342.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60859130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B10,B50
`Chr3:60859163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60859231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr3:60859283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B54,C12,D11
`Chr3:60860242`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	168	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A21,A22,A23,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B102,B103,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B115,B118,B119,B120,B121,B124,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B137,B138,B139,B15,B17,B19,B2,B20,B23,B25,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B49,B5,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B63,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C32,C34,C35,C38,C39,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C77,C78,C80,C81,C82,C83,C85,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr3:60860468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B8
`Chr3:60860619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C6
`Chr3:60860992`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	148	A11,A13,A16,A2,A21,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B100,B104,B107,B108,B109,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B125,B127,B129,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B20,B21,B22,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B51,B54,B57,B59,B61,B62,B63,B65,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B86,B89,B91,B93,B99,C11,C14,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C36,C37,C4,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C55,C57,C6,C63,C64,C66,C69,C72,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C86,C87,C9,D2,D5,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799342.1

495 aa

248

495

p450

PF00067 p450 29-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799342.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	29	467	7.2e-105	352.1	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943359.1
AGTCAATATGCATTCATTTATTATTATTATCAGCTGCCAGTGTTGAATATCAGCAAACTCACTCATATTTTACTCACACAATTCTAACTAGTTTATTTACGCATATATATAAAAAGGCCAACTCCCACTAAGAGTGTAGAGACAGCCACCAAACTTGAAGAAGAGATAAAAAATGGAGTCCTCTCCTCTCCTCGCCGCGCTCTTCTTCATCGCCGCGACGATAACATTCCTCTCCTTCCGGCGCCGGAGGAACCTCCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015108
ATGGAGTCCTCTCCTCTCCTCGCCGCGCTCTTCTTCATCGCCGCGACGATAACATTCCTCTCCTTCCGGCGCCGGAGGAACCTCCCTCCGGGGCCGTTCCCCTACCCGATCGTCGGAAACATGCTGCAACTCGGCGCCAACCCTCACCAGGTGTTCGCGAAGCTCTCAAAGAGATACGGCCCGCTGATGTCGATCCATCTCGGCAGCCTCTACACCGTGATCGTCTCCTCCCCGGAGATGGCGAAGGAGATCCTCCACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799342.1
MESSPLLAALFFIAATITFLSFRRRRNLPPGPFPYPIVGNMLQLGANPHQVFAKLSKRYGPLMSIHLGSLYTVIVSSPEMAKEILHRHGQVFSGRTIAQAVHACDHDKISMGFLPVASEWRDMRKICKEQMFSNQSMEASQGLRRQKLQQLLDHVQKCSDSGRAVDIREAAFITTLNLMSATLFSSQATEFDSKATMEFKEIIEGVATIVGVPNFADYFPILRPFDPQGVKRRADVFFGKLLAKIEGYLTERLESKRANP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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