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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004278`

染色体: Chr03 坐标: 61221053-61224792 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004278`
名称	SmilChr03G004278
描述	uncharacterized SmilChr03G004278
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61221053 - 61224792 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015160`
GeneID	`131015160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015160`
原始查询	`LOC131015160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0175000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0175000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G20060` (AT5G20060) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832128] identity=65.6; qcov=1; evalue=2.73e-128; confidence=high
Rice	`Os01g0175000` - identity=71; qcov=0.98; evalue=1.21e-137; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02230 (Abhydrolase_2); PF03959 (FSH1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799414.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799414.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057799414.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799414.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61221269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:61221329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C18,C45
`Chr3:61221445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C74,C80
`Chr3:61221512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:61221700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,C13,D10,D5
`Chr3:61221901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B19
`Chr3:61221902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C13
`Chr3:61222865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A16,B10,B29,D3
`Chr3:61222881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799414.1

253 aa

126

253

Abhydrolase_2

FSH1

PF02230 Abhydrolase_2 23-244 aa PF03959 FSH1 81-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799414.1`	Pfam	`PF02230`	Abhydrolase_2	Domain	23	244	1.4e-37	130.4	Phospholipase/Carboxylesterase
`XP_057799414.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	81	206	2.4e-06	28.1	Serine hydrolase (FSH1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943431.1
CCTAGAGCAGTTCACATGAAAACAGGGTACGGTCTAGACAAATAGGCAGACAAAAAGGAATGTAGAAACCGGAAAAGCCTAAGCACTTTATTGCAGTGTTCAATACTTACAACTCTAGAACCTCGGCTCCAAATTAAAGCTTAAACCCCACTTATCTTTCACATTTTCACACCGCTAGGTTCAGCCATTTCTATCTTCTAGTATCAGGAGCTAGTTCAATTGCAATCACTCAACACATATACACTTGTGCATTTGTTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015160
ATGAGCTTCAATAGCGCTGCAGGGGGTGGCCAACCCTCTAGAACAACATTTGAGTTTGGAAGGACTCATGTAGTCAGGCCAAAAGGGAGGCATCAAGCAACGATAATTTGGCTACATGATCTTGGTGATAAAGGGTCTAGCTGGTCTCAGCAATTGGAAAGCCTTCCTCTTCCTAACGTAAAGTGGATATGCCCGACTGCTCCTACTCGTCCAGTTTCTTTATTTGGGGGATTTCCTTGCACTGCATGGTTCGATGCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799414.1
MSFNSAAGGGQPSRTTFEFGRTHVVRPKGRHQATIIWLHDLGDKGSSWSQQLESLPLPNVKWICPTAPTRPVSLFGGFPCTAWFDAQDISEDAPDDLQGLDASAAHVANLLSTEPADIKLGIGGFSMGAATALYSATCHIFGQYANRNPYLVNLSCVIGLSGWLPCSRMLRNRMERSNEIVRRAASLPILLCHGSGDDVVAYKHGENSARTLSSAGFQNLMFRSYGGLGHYTIPEEMDEVCCWLTASLGLQGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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