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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000264`

染色体: Chr01 坐标: 5088159-5097057 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000264`
名称	SmilChr01G000264
描述	uncharacterized SmilChr01G000264
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5088159 - 5097057 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015764`
GeneID	`131015764`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015764`
原始查询	`LOC131015764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0484700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0484700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G77670` (AT1G77670) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844103] identity=41.4; qcov=0.881; evalue=1.04e-99; confidence=medium
Rice	`Os10g0484700` - identity=66.2; qcov=0.897; evalue=5.92e-178; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0016212 (L-kynurenine:2-oxoglutarate transaminase activity); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2); PF01041 (DegT_DnrJ_EryC1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015764

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057800175.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800175.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057800175.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800175.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800175.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5088400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:5088489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:5088938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:5088972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B103,B25,B31,C80
`Chr1:5089195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B27,C37
`Chr1:5091401`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A11,A14,A19,B1,B106,B124,B20,B33,B40,B51,C55,C76,C83
`Chr1:5092171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:5092193`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B53
`Chr1:5092193`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B53
`Chr1:5092510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C43,D8
`Chr1:5093593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:5093604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800175.1

436 aa

218

436

Aminotran_1_2

DegT_DnrJ_EryC1

PF00155 Aminotran_1_2 66-406 aa PF01041 DegT_DnrJ_EryC1 142-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800175.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	66	406	2.8e-56	192.0	Aminotransferase class I and II
`XP_057800175.1`	Pfam	`PF01041`	DegT_DnrJ_EryC1	Domain	142	199	6.4e-07	29.6	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944192.1
GAAGTCACAGAGTCTTATGCAAAGCTTACCTGCAGCTGCAGTGCAGGAACAACAACAACATTTGAGAAGTCACGGAACTCGTTTACTCAAGATAATGCAAATGGCGGAGTTAGGAAAAGAGAAGCAAATGGAGAAATTATCTAGTGTGGCAAAGACTCTTGAACCATCTCCAATTCAACAATTATCTTTCCTTGCGCAACGATGCAACGCCATCAACCTCGCCGAGGGATTTCCCGATTTTGTCGCTCCCGCTCACGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015764
ATGCAAAGCTTACCTGCAGCTGCAGTGCAGGAACAACAACAACATTTGAGAAGTCACGGAACTCGTTTACTCAAGATAATGCAAATGGCGGAGTTAGGAAAAGAGAAGCAAATGGAGAAATTATCTAGTGTGGCAAAGACTCTTGAACCATCTCCAATTCAACAATTATCTTTCCTTGCGCAACGATGCAACGCCATCAACCTCGCCGAGGGATTTCCCGATTTTGTCGCTCCCGCTCACGTCAAAAATGCCGCCGTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800175.1
MQSLPAAAVQEQQQHLRSHGTRLLKIMQMAELGKEKQMEKLSSVAKTLEPSPIQQLSFLAQRCNAINLAEGFPDFVAPAHVKNAAVIAINSDFNQYRHVQGICDYVAQKMKEMHGMSIDPLTDIVICCGQSEAFAAAIFAIIDHGDEVVLFDPSYETYDTCIRLAGGVPVYVSLDPPYWTFDPIKLEKAFTDKTKAVVLNSPHNPTGKVFSKDELEVISEACMRRDVLAVTDEVYEHITYDSRSHMSLASLPGMQSRTII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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