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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000253`

染色体: Chr03 坐标: 2993546-2994952 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000253`
名称	SmilChr03G000253
描述	uncharacterized SmilChr03G000253
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2993546 - 2994952 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015791`
GeneID	`131015791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015791`
原始查询	`LOC131015791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0687100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0687100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G46860` (PPa3) pyrophosphorylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819299] identity=91.4; qcov=0.339; evalue=6.71e-33; confidence=low
Rice	`Os04g0687100` - identity=94.8; qcov=0.339; evalue=4.36e-34; confidence=low
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004427 (inorganic diphosphate phosphatase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006796 (phosphate-containing compound metabolic process)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00719 (Pyrophosphatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800198.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800198.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800198.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057800198.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800198.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2993571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:2993800`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A16,A18,A4,B71,B81,B93,C62
`Chr3:2994124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C27
`Chr3:2994124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr3:2994141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B124,C13,C28
`Chr3:2994149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C34
`Chr3:2994172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C31
`Chr3:2994180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B110,B6,C22
`Chr3:2994188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C31
`Chr3:2994303`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	A1,A16,A18,A2,A20,A23,A6,A8,B113,B117,B122,B24,B25,B31,B32,B36,B38,B50,B54,B55,B65,B72,B74,B81,B98,C10,C16,C27,C30,C42,C46,C47,C49,C55,C59,C61,C71,C83,C84,C86,C87,D10
`Chr3:2994310`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,B19,B70,B73,C15
`Chr3:2994310`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A3,B19,B70,B73,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800198.1

171 aa

171

Pyrophosphatase

PF00719 Pyrophosphatase 94-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800198.1`	Pfam	`PF00719`	Pyrophosphatase	Domain	94	154	1.4e-24	87.4	Inorganic pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944215.1
ATGGTTTGCTCTAAATATCACTTCCCTACCCCCGCGCTAGCTGCTCCGCCCCCTGCCCCGTCTGCTGCCTCTCCTCGCCGCCGCGCCGCCGGAGTCGCTCTACACGAGCAGCCGGAGTCCCCTGCTGCTGTCTGCCGCCGCTTCTCTCCCCTGCCGGATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATTTGAAAGTTTATGCCAAATTCGAGTTGTCGTTCACCTGCCGGAATCGCCACATTCTGATTCTCCTTTGCTCTCTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015791
ATGGTTTGCTCTAAATATCACTTCCCTACCCCCGCGCTAGCTGCTCCGCCCCCTGCCCCGTCTGCTGCCTCTCCTCGCCGCCGCGCCGCCGGAGTCGCTCTACACGAGCAGCCGGAGTCCCCTGCTGCTGTCTGCCGCCGCTTCTCTCCCCTGCCGGATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAATTTGAAAGTTTATGCCAAATTCGAGTTGTCGTTCACCTGCCGGAATCGCCACATTCTGATTCTCCTTTGCTCTCTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800198.1
MVCSKYHFPTPALAAPPPAPSAASPRRRAAGVALHEQPESPAAVCRRFSPLPDLLSLSLSNLKVYAKFELSFTCRNRHILILLCSLASPFLQQVVEISKGSKVKYELDKKTGLIKVDRVLYSSVVYPHNYGFIPRTLCEDSDPMDVLVIMQVKCWSRIFTKYFRRELFPYD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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