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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002730`

染色体: Chr03 坐标: 43366771-43368724 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002730`
名称	SmilChr03G002730
描述	sm-like protein LSM36B
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43366771 - 43368724 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015902`
GeneID	`131015902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015902`
原始查询	`LOC131015902`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sm-like protein LSM36B
产物	sm-like protein LSM36B
Arabidopsis	`AT2G43810` (LSM6B) Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818985] identity=89; qcov=1.01; evalue=1.3e-55; confidence=high
Rice	`Os02g0510100` (OsCYP-7) - identity=92.6; qcov=0.9; evalue=6.96e-52; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0000932 (P-body); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005688 (U6 snRNP); GO:0005730 (nucleolus); GO:0005732 (sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex); GO:0030490 (maturation of SSU-rRNA); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800381.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057800381.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800381.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800381.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43367329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:43368314`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B122,B68
`Chr3:43368314`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B122,B68
`Chr3:43368327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:43368405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800381.1

90 aa

LSM

PF01423 LSM 16-80 aa

XP_057800382.1

90 aa

LSM

PF01423 LSM 16-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800381.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	16	80	6.2e-20	71.4	LSM domain
`XP_057800382.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	16	80	6.2e-20	71.4	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944399.1
AGCCCACTTAGCAGCCCAGTCCAAAAAACACAAATTGAAAACCTAATGACCAAAGAACCCTGAATTCACTTCTCTAGTTTGGATTCAAGAAAGTTGAGGCAACAAGAAGGACAAGGAAAAAGATTACAAGTTGTCAAATTAAATTTCTTCTTCTCTCTCTGGAATCGCAATCACCGATCGCACCAAATCGCGTCGTCGCCGGAGTCTACAGATTTTCTTGCAGTTTTGCAATTAATTTGGAAAAATGAGCGGTGCCGGGG...

XM_057944398.1
CTTAGCAGCCCAGTCCAAAAAACACAAATTGAAAACCTAATGACCAAAGAACCCTGAATTCACTTCTCTAGTTTGGATTCAAGAAAGTTGAGGCAACAAGAAGGACAAGGAAAAAGATTACAAGTTGTCAAATTAAATTTCTTCTTCTCTCTCTGGAATCGCAATCACCGATCGCACCAAATCGCGTCGTCGCCGGAGTCTACAGATTTTCTTGTTTTGCAATTAATTTGGAAAAATGAGCGGTGCCGGGGAGAAACTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015902
ATGAGCGGTGCCGGGGAGAAACTGTCGGGCACGAAAACTCCGGCAGATTTTCTGAAATCTATACGTGGACGACCTGTGGTTGTCAAATTGAACTCCGGTGTCGATTATAGAGGTATCCTTGCATGTCTGGATGGATACATGAATATTGCAATGGAACAAACAGAGGAGTATGTGAATGGCCAGCTGAAGAACAAATATGGAGATGCCTTCATCAGAGGAAATAATGTACTCTACATCAGCACATCGAAGGGAACCTTGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800381.1
MSGAGEKLSGTKTPADFLKSIRGRPVVVKLNSGVDYRGILACLDGYMNIAMEQTEEYVNGQLKNKYGDAFIRGNNVLYISTSKGTLAEGA

XP_057800382.1
MSGAGEKLSGTKTPADFLKSIRGRPVVVKLNSGVDYRGILACLDGYMNIAMEQTEEYVNGQLKNKYGDAFIRGNNVLYISTSKGTLAEGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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