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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002750`

染色体: Chr03 坐标: 43680828-43688933 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002750`
名称	SmilChr03G002750
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43680828 - 43688933 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015925`
GeneID	`131015925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015925`
原始查询	`LOC131015925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit
产物	serine/threonine-protein phosphatase PP2A-2 catalytic subunit
Arabidopsis	`AT3G58500` (PP2A-4) protein phosphatase 2A-4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825019] identity=97.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0805300` (OsPP56) - identity=98.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000278 (mitotic cell cycle); GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0070262 (peptidyl-serine dephosphorylation)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00149 (Metallophos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800422.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800422.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800422.1`
4	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057800423.1`
5	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057800422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43681110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A21,B53,B66
`Chr3:43681163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B82,C65
`Chr3:43688365`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:43688365`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:43688378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:43688578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800422.1

313 aa

156

313

Metallophos

PF00149 Metallophos 55-248 aa

XP_057800423.1

270 aa

135

270

Metallophos

PF00149 Metallophos 12-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800422.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	55	248	3.5e-47	162.1	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057800423.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	12	205	2.4e-47	162.6	Calcineurin-like phosphoesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944439.1
AGTTTAAAATACTAAAATACAGATATCTAAAATTTGATCGTCTCTCTCCCCTTCCCTCTCTTCATCGTTACCACCACCACCATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATGTAGTTACAATCTTTTACAGTAATTATCATCCTAGGATTCACATCCTATCCCGGGATAAGGAATACCCATTCACCATTTCGACACAAGAAAGTGACGTCGCATCGGACGGCGGCGGATCTGATACAGATCACAAATTG...

XM_057944440.1
CGGAAATCGCATCTGAGGCGGCGCCTCACTTGATGTGAATGGGGCACACGCCTCGGCCCAGGGCGATCATCTTCTGTATCATTTATTCTCTTATCAGGGATCTCCATATCCATAAACCACCTAGGGTTTTTAATAGTGCTTCCTTCTATTGAAGAATATTTTGCATTGCCTCATGCAATTTCTGTGGGAATTTGCTAATTTTAATTATATCTCAGGAATCAGGATTGTACCTTTATAGAAAATTGAGAAAATGGGGATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015925
ATGAATGCGGATCTGGTGGCTCCGACCGCCCATGGGAATCTGGACGAACAGATTTCTCAGCTTATGCAGTGCAAACCCTTGTCCGAGCCCGAGGTTAGAACATTATGTGAGAAGGCTAAGGAGATACTCATGCAGGAAAGCAATGTCCAGCCTGTGAAAAGTCCTGTGACAATTTGTGGTGATATTCATGGACAATTTCATGACCTTGCTGAACTATTCCGCATTGGAGGGAAGTGTCCGGACACAAACTATCTATTTAT...

LOC131015925
ATGCAGGAAAGCAATGTCCAGCCTGTGAAAAGTCCTGTGACAATTTGTGGTGATATTCATGGACAATTTCATGACCTTGCTGAACTATTCCGCATTGGAGGGAAGTGTCCGGACACAAACTATCTATTTATGGGAGATTATGTTGATCGTGGTTACTATTCAGTTGAAACAGTTACTCTACTAGTGGCATTGAAAGTGCGCTATCCTCAACGTATCACAATTCTTAGAGGAAATCATGAAAGCAGACAGATCACTCAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800422.1
MNADLVAPTAHGNLDEQISQLMQCKPLSEPEVRTLCEKAKEILMQESNVQPVKSPVTICGDIHGQFHDLAELFRIGGKCPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPQRITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSANVWKTFTDLFDYFPLTALVESEIFCLHGGLSPSIETLDNIRNFDRVQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRCGWGISPRGAGYTFGQDISEQFNHTNNLKLIARAHQLVMEGYNWAHEQKV...

XP_057800423.1
MQESNVQPVKSPVTICGDIHGQFHDLAELFRIGGKCPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPQRITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSANVWKTFTDLFDYFPLTALVESEIFCLHGGLSPSIETLDNIRNFDRVQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRCGWGISPRGAGYTFGQDISEQFNHTNNLKLIARAHQLVMEGYNWAHEQKVVTIFSAPNYCYRCGNMASILEVDDCREHTFIQFEPAPRRGEPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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