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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002804`

染色体: Chr03 坐标: 44515892-44518232 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002804`
名称	SmilChr03G002804
描述	eukaryotic peptide chain release factor subunit 1-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44515892 - 44518232 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015990`
GeneID	`131015990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015990`
原始查询	`LOC131015990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic peptide chain release factor subunit 1-3
产物	eukaryotic peptide chain release factor subunit 1-3
Arabidopsis	`AT3G26618` (ERF1-3) eukaryotic release factor 1-3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822273] identity=91.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0702800` (OSJNBa0004L11.18) - identity=91.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002184 (cytoplasmic translational termination); GO:0005829 (cytosol); GO:0016149 (translation release factor activity, codon specific); GO:0018444 (translation release factor complex); GO:1990825 (sequence-specific mRNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03463 (eRF1_1); PF03464 (eRF1_2); PF03465 (eRF1_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800510.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800510.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057800510.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057800510.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44517239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:44517566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:44517805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:44518029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B66,B85,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800510.1

437 aa

218

437

eRF1_1

eRF1_2

eRF1_3

PF03463 eRF1_1 11-139 aa PF03464 eRF1_2 143-276 aa PF03465 eRF1_3 280-417 aa

XP_057800511.1

437 aa

218

437

eRF1_1

eRF1_2

eRF1_3

PF03463 eRF1_1 11-139 aa PF03464 eRF1_2 143-276 aa PF03465 eRF1_3 280-417 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800510.1`	Pfam	`PF03463`	eRF1_1	Domain	11	139	2e-56	190.3	eRF1 domain 1
`XP_057800510.1`	Pfam	`PF03464`	eRF1_2	Domain	143	276	2.4e-43	148.4	eRF1 domain 2
`XP_057800510.1`	Pfam	`PF03465`	eRF1_3	Domain	280	417	8.9e-33	113.7	eRF1 domain 3
`XP_057800511.1`	Pfam	`PF03463`	eRF1_1	Domain	11	139	2e-56	190.3	eRF1 domain 1
`XP_057800511.1`	Pfam	`PF03464`	eRF1_2	Domain	143	276	2.4e-43	148.4	eRF1 domain 2
`XP_057800511.1`	Pfam	`PF03465`	eRF1_3	Domain	280	417	8.9e-33	113.7	eRF1 domain 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944527.1
TGTAATTTTAGCCTTTCAATTCTACTCATTTTGTATTGAAGAAAAGATAAAATATCTTTCCATTTTTATATAGTATTTGTCAAGTAGGATTTAGATATTTCATAATTTTGGAGCAAATATTGAAAAAACCATAAGAGGAAGAAAACATGAATTGGATGGAGGCAGTTAATTAAACTAGGGTTTTGGGTGAACCTCAAAAGTCTACATCAGTCAAAACCAGCTGCTTCATTTCCGGCCACCCAATCTTTTGAGGCTGTGAA...

XM_057944528.1
AGAAAAGATAAAATATCTTTCCATTTTTATATAGTATTTGTCAAGTAGGATTTAGATATTTCATAATTTTGGAGCAAATATTGAAAAAACCATAAGAGGAAGAAAACATGAATTGGATGGAGGCAGTTAATTAAACTAGGGTTTTGGGTGAACCTCAAAAGTCTACATCAGTCAAAACCAGCTGCTTCATTTCCGGCCACCCAATCTTTTGAGTGGAAATGGCGGATGGTGAGTCTGACAGGAATATTGAGATATGGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015990
ATGGCGGATGGTGAGTCTGACAGGAATATTGAGATATGGAAAATCAAGAAACTGATCAAGGCATTGGAATCAGCTAGAGGCAATGGAACCAGCATGATATCACTTATTATGCCTCCACGGGATCAAATCTCACGGGTTGCTAAGATGCTTGGTGATGAATATGGAACTGCTTCAAATATTAAGAGCAGGGTAAATCGTCAATCCGTGCTCGGTGCCATTACTTCAGCCCAGCAGAGGCTCAAACTGTATAATAAGGTTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800510.1
MADGESDRNIEIWKIKKLIKALESARGNGTSMISLIMPPRDQISRVAKMLGDEYGTASNIKSRVNRQSVLGAITSAQQRLKLYNKVPPNGLVLYTGTIVTDDGKEKKVTIDFEPFKPINASLYLCDNKFHTEALNELLESDDKFGFIVMDGNGTLFGTLSGNTREVLHKFTVDLPKKHGRGGQSALRFARLRMEKRHNYVRKTAELATQFYINPNTSQPNVSGLILAGSADFKTELSQSDMFDPRLQAKILNVVDVSYGG...

XP_057800511.1
MADGESDRNIEIWKIKKLIKALESARGNGTSMISLIMPPRDQISRVAKMLGDEYGTASNIKSRVNRQSVLGAITSAQQRLKLYNKVPPNGLVLYTGTIVTDDGKEKKVTIDFEPFKPINASLYLCDNKFHTEALNELLESDDKFGFIVMDGNGTLFGTLSGNTREVLHKFTVDLPKKHGRGGQSALRFARLRMEKRHNYVRKTAELATQFYINPNTSQPNVSGLILAGSADFKTELSQSDMFDPRLQAKILNVVDVSYGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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