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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003033`

染色体: Chr03 坐标: 47239273-47243559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003033`
名称	SmilChr03G003033
描述	elongation factor Tu, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47239273 - 47243559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016177`
GeneID	`131016177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016177`
原始查询	`LOC131016177`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor Tu, mitochondrial-like
产物	elongation factor Tu%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G02930` (AT4G02930) GTP binding Elongation factor Tu family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828134] identity=84.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0851100` - identity=88.2; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0070125 (mitochondrial translational elongation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03143 (GTP_EFTU_D3); PF03144 (GTP_EFTU_D2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800789.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057800789.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800789.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800789.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47239426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47239470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C85
`Chr3:47239490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B19,B85
`Chr3:47239546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C47
`Chr3:47242060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47243238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800789.1

449 aa

224

449

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

GTP_EFTU_D3

PF00009 GTP_EFTU 62-255 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 279-349 aa PF03143 GTP_EFTU_D3 353-447 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800789.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	62	255	1e-62	211.8	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057800789.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	279	349	2.8e-21	76.4	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057800789.1`	Pfam	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	Domain	353	447	5.3e-37	127.1	Elongation factor Tu C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944806.1
CTAAAACCCTGACATCCAAAAACCTTTGTTATTCTTCCTCAAGTCTTACCTCACTCTCTCTTCCCTCTCTCTGCATCACTGCTTCACTTTGCTACTGCACCAAATGGCCTCTGTGGCGCTCAGGAACATAAATTCGAAGCGACTGCTCACTCTCTCTCCCCAAATTTACTCATCATGCTGCCGAGGATCCGCCGTCGCCGCACCCTTCTCCGTTTCCGAATCGCCGATAGGTTCTCATCAGATGCCCAATCCGTGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016177
ATGGCCTCTGTGGCGCTCAGGAACATAAATTCGAAGCGACTGCTCACTCTCTCTCCCCAAATTTACTCATCATGCTGCCGAGGATCCGCCGTCGCCGCACCCTTCTCCGTTTCCGAATCGCCGATAGGTTCTCATCAGATGCCCAATCCGTGGTGGAGATCCATGGCTACCTTTACTCGGACAAAACCTCATGTCAATGTGGGAACCATTGGGCATGTTGACCATGGAAAGACCACCTTGACTGCAGCTATTACAAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800789.1
MASVALRNINSKRLLTLSPQIYSSCCRGSAVAAPFSVSESPIGSHQMPNPWWRSMATFTRTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKVLAEEGKAKAVAFDEIDKAPEEKKRGITIATAHVEYETVKRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGGILVVSAPDGPMPQTKEHILLARQVGVPSLVCFLNKVDAVDDPELLELVEMELRELLSFYKFPGDDIPIVRGSALSALEGKNEEIGKQAILKLMDAVDSYIPDPVRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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