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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000332`

染色体: Chr01 坐标: 6771229-6774681 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000332`
名称	SmilChr01G000332
描述	probable nucleolar protein 5-2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	6771229 - 6774681 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016318`
GeneID	`131016318`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016318`
原始查询	`LOC131016318`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable nucleolar protein 5-2
产物	probable nucleolar protein 5-2
Arabidopsis	`AT5G27120` (AT5G27120) NOP56-like pre RNA processing ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832770] identity=74.8; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0350300` (BIP102) - identity=75.7; qcov=0.933; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030515 (snoRNA binding); GO:0031428 (box C/D methylation guide snoRNP complex); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01798 (Nop); PF08156 (NOP5NT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016318

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800986.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057800986.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.80000	`XP_057800986.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057800986.1`
5	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057800986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:6771965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:6772907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:6773433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:6773454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:6773459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B74
`Chr1:6773607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr1:6774241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B17,B4,C79,C9
`Chr1:6774303`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B47,B86,C54
`Chr1:6774303`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B47,B86,C54
`Chr1:6774304`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B47,C54
`Chr1:6774304`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B47,C54
`Chr1:6774385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C5,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800986.1

551 aa

276

551

NOP5NT

Nop

PF08156 NOP5NT 2-65 aa PF01798 Nop 166-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800986.1`	Pfam	`PF08156`	NOP5NT	Domain	2	65	6.3e-19	68.8	NOP5NT (NUC127) domain
`XP_057800986.1`	Pfam	`PF01798`	Nop	Family	166	394	2.5e-85	286.3	snoRNA binding domain, fibrillarin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945003.1
TACCTCTTATATATATATATATATAGCAGCACACCTGTTTTCCTAAAACCCTTATACCGAGCCGTTTCTTAAAACCCTAGTCTCTAATTTTTCTAAAATCTTAAGACTGCGGCGGCTAGTGTTCGGTGGTGGTCGGAATATGTTGCTTCTATTTGAAACTCCGGCAGGCTTTGCGCTCTTCAAAGTCCTCGATGAAGGGAAACTTTCTAAAGTCGAGGATTTGGGGAAGGAATTTGCCTCGCCTGACTCCGCTAGAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016318
ATGTTGCTTCTATTTGAAACTCCGGCAGGCTTTGCGCTCTTCAAAGTCCTCGATGAAGGGAAACTTTCTAAAGTCGAGGATTTGGGGAAGGAATTTGCCTCGCCTGACTCCGCTAGAAAGGTAGTCAAGCTGAAAGCATTCTCAAAATTTGAGAATACTGCAGAGGCTTTGTCTGCTGCTACTCTACTGATAGATAGTAAACCCAGCAAAGGTCTCCGGAAATTCCTGCGCAGTCATTGTGATGGTGACATTTTAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800986.1
MLLLFETPAGFALFKVLDEGKLSKVEDLGKEFASPDSARKVVKLKAFSKFENTAEALSAATLLIDSKPSKGLRKFLRSHCDGDILAVADSKLGNTIKEKLQIECVHNNSVMELMRGVRSQLTELISGLAAQDMAPMSLGLSHSLSRYKLKFSPDKVDTMIIQAISLLDDLDKELNTYAMRVREWYGWHFPELAKIVQDNILYAKSVKLMGYRSNAAKLDFSEILLEEVETELKEAAVISMGTEVSDLDLENIKDLCNQVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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