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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002527`

染色体: Chr03 坐标: 40310729-40315118 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002527`
名称	SmilChr03G002527
描述	uncharacterized SmilChr03G002527
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40310729 - 40315118 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016689`
GeneID	`131016689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016689`
原始查询	`LOC131016689`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817427]; symbol=AT2G28780; hit=AT2G28780; species=arabidopsis; confidence=low
产物	P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817427]; symbol=AT2G28780; hit=AT2G28780; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G28780` (AT2G28780) P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817427] identity=34; qcov=1.06; evalue=6.02e-108; confidence=low
Rice	`Os11g0100300` - identity=28.5; qcov=1.1; evalue=1.4e-40; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04632 (FUSC); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057801376.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057801376.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057801376.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057801376.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40310812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B33,C13,D6
`Chr3:40310841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B124,B49,B79
`Chr3:40312065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:40312083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B10,B12,B51,B55
`Chr3:40312436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B31,B69,B81,D5
`Chr3:40312486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:40312521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B65
`Chr3:40312687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:40312898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B97,C41,C64,C9
`Chr3:40312933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:40312949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:40312961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801376.1

610 aa

305

610

FUSC

FUSC_2

PF04632 FUSC 241-454 aa PF13515 FUSC_2 254-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801376.1`	Pfam	`PF04632`	FUSC	Family	241	454	3.4e-11	43.2	Fusaric acid resistance protein family
`XP_057801376.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	254	379	1.2e-11	45.6	Fusaric acid resistance protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945393.1
GCAGTGCTTAGTGATGGGTCGAGTGGTGGCTTCATGCACCCTTTGTACGTTGCTGCGAGTACTGCTCTAGGAGCCTTGGCATCCGTCTTCGCTTTGCTCCTTCCCTTCCCGGCTCTTGCCTCTCATAAGGTGGAAGAGCTGTGCCGAGTGTATGCTGAGAATGCTTCAGAAAGAATGAATGTATACCTACGCGCTCTAACGGCGACGGACAAGCATACTAAGATACACCTCATCTCACAAGCCAAGACCTTGTCCGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016689
ATGCACCCTTTGTACGTTGCTGCGAGTACTGCTCTAGGAGCCTTGGCATCCGTCTTCGCTTTGCTCCTTCCCTTCCCGGCTCTTGCCTCTCATAAGGTGGAAGAGCTGTGCCGAGTGTATGCTGAGAATGCTTCAGAAAGAATGAATGTATACCTACGCGCTCTAACGGCGACGGACAAGCATACTAAGATACACCTCATCTCACAAGCCAAGACCTTGTCCGAAACAGGAGCCAAGCTTTTGCAGACTATCAAAATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801376.1
MHPLYVAASTALGALASVFALLLPFPALASHKVEELCRVYAENASERMNVYLRALTATDKHTKIHLISQAKTLSETGAKLLQTIKILEDGLWWERPWSKAIKPGERLQSMELEMRGIEYSLISSATIIPFQAVEQHQISQISQAISTRIEERIQQLRCYSPFNSKVESETRQLMANSSSLLELKLPNPKQGWLYFYFSCIHMFLNDTVCCNSAASRNPETKAQGIATRFKHWIHKLTTHDRLLFATKCSLCLSLAVLLGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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