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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002611`

染色体: Chr03 坐标: 41521309-41523073 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002611`
名称	SmilChr03G002611
描述	beta-1,4-xylosyltransferase IRX9-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41521309 - 41523073 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016767`
GeneID	`131016767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016767`
原始查询	`LOC131016767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-1,4-xylosyltransferase IRX9-like
产物	beta-1%2C4-xylosyltransferase IRX9-like
Arabidopsis	`AT2G37090` (IRX9) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818285] identity=49.1; qcov=1.14; evalue=4.48e-110; confidence=high
Rice	`Os07g0694400` (OsIRX9) - identity=37.9; qcov=1.07; evalue=3.31e-65; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0009834 (plant-type secondary cell wall biogenesis); GO:0010417 (glucuronoxylan biosynthetic process); GO:0015018 (galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity); GO:0042285 (xylosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03360 (Glyco_transf_43)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057801479.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057801479.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801479.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801479.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41521924`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr3:41521924`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr3:41521983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B102,C13,C82,D10
`Chr3:41522002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:41522248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B49,C26
`Chr3:41522368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:41522425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B12,B49,B79,C77
`Chr3:41522464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B131
`Chr3:41522464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:41522487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:41522515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:41522535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B46,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801479.1

303 aa

152

303

Glyco_transf_43

PF03360 Glyco_transf_43 95-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801479.1`	Pfam	`PF03360`	Glyco_transf_43	Family	95	298	4.6e-55	187.4	Glycosyltransferase family 43

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945496.1
AACAACTTTCTTTCTAAGCAAAAACCAATAGTTCTTCCCCATTAATCTTTCTTCTATTTCAAGTCATCACTTGGTAAAGCAAACTCCTCACATCTCCAATCACAAACCACAACATGATTGAAAGTTAACCAGCAAGGAAATTGGTAGTTGTATATTGAGTCCCTCCATTTCAAGAAAATCCATTATATCACCTACCAAAGCAAAAAAACATTCTTGATTCACTCACACACACACACACACACACTACCATCATAGATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016767
ATGATGATGGGATCTCAAGAGAGATCAAGAAAAAAGATTCACATATGGAAGAAAGCCATACTTCATTTCCTCTTGTGCTTTGTGATGGGATTCTTGACAGGCTTCACCCCCACAAGGAGATCTCCAAGCCATGTCACAATGCTCCTCTCCTCGCCTCAGCACGTGGAACATAACCACCCTTTCAAAAGGAGTGCTCCGGTGATGAATGGGGAGAAGCTCGTGATCATCGTGTCGCCAACCAGCACGAGAAACAAGCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801479.1
MMMGSQERSRKKIHIWKKAILHFLLCFVMGFLTGFTPTRRSPSHVTMLLSSPQHVEHNHPFKRSAPVMNGEKLVIIVSPTSTRNKLLRNVLLTRLAHTLKLVAQPLLWVVVEPKSHDDHDPGVSQVLRKTGIMYRHLVCDEDLRDEDEQRNLALNHIEHHRLSGVVHFAGLANAYDLAFFQEIRAIEAFGAWPIAKMRANRKKVMIQGPVCDSSRVMGWHLKKMKNQTVEMPPPIHISSFAFNSSILWDPERWGRTFSTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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