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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000707`

染色体: Chr03 坐标: 7864881-7869100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000707`
名称	SmilChr03G000707
描述	phosphoribulokinase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	7864881 - 7869100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017332`
GeneID	`131017332`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017332`
原始查询	`LOC131017332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoribulokinase, chloroplastic
产物	phosphoribulokinase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G32060` (PRK) phosphoribulokinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840098] identity=82.9; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0698000` (OsPrk) - identity=82.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0008974 (phosphoribulokinase activity); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	smil00710 (Carbon fixation by Calvin cycle - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00485 (PRK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017332

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057802038.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057802038.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802038.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802038.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:7865142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:7865143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B53
`Chr3:7865182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B53
`Chr3:7865203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B40,B93,C53
`Chr3:7865212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B2
`Chr3:7865432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr3:7865437`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	B105,B132,B19,B22,B3,B47,B55,B56,B57,B62,B69,B75,B80,B96,C13,C30,C41,C47,C56,C62,C70,C81,C86,D7
`Chr3:7865450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:7865468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B52,C72,C78,C8
`Chr3:7865471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B48,D5
`Chr3:7865498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B52,C78,C8
`Chr3:7865600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802038.1

399 aa

200

399

PRK

PF00485 PRK 55-253 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802038.1`	Pfam	`PF00485`	PRK	Domain	55	253	6.1e-80	268.4	Phosphoribulokinase / Uridine kinase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946055.1
AAATTAATTGTATAAAACACAAAATCCATTTCATATATAAATAAAAAAAAATATACTATACTACTCAAGGGAGTAACTAAAAATTTATATATATAAAAAAAATCAACAATTGCCAATCAAAATACCTTAAACAGTGACACACGACACCCAAAAACAGCCTCCTATCCTCAAAAACTCGCATCATTTTTACTCTAAACCACACACCCTCCCCTCCCTATATCTCTCATTTTTTCTGTCCTCACAATTTTATCATTCATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017332
ATGGCAGCAGTCTCCACAGTCTACACACTCAACTCCACCTGCTCAATCTCCACACCATCAAAGCCCCTCACACACAAACACCTAGTCTTCTTCACCACCACCACCGCCACGAAGAGATCATCGCGGCGGGCGATATCATGCTCCGGCGAGGACAAGACGGTGGTGATCGGGCTGGCGGCGGACTCGGGGTGCGGGAAGTCGACGTTCATGCGGCGGCTGACCTCCGTGTTCGGGGGCGCGGCGGAGCCCCCGAAGGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802038.1
MAAVSTVYTLNSTCSISTPSKPLTHKHLVFFTTTTATKRSSRRAISCSGEDKTVVIGLAADSGCGKSTFMRRLTSVFGGAAEPPKGGNPDSNTLISDTTTVICLDDYHSLDRTGRKEKGVTALDPRANDFDLMYQQVKALKDGTPVDKPIYNHVSGLLDPPELIKPPKILVIEGLHPMYDQRVRDLLDFSIYLDISNEVKFAWKIQRDMAERGHSLESIKASIEARKPDFDAYIDPQKQYADAVIEVLPTQLIPDDNEGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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