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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001429`

染色体: Chr03 坐标: 16947341-16953786 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001429`
名称	SmilChr03G001429
描述	probable polygalacturonase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16947341 - 16953786 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017901`
GeneID	`131017901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017901`
原始查询	`LOC131017901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase
产物	probable polygalacturonase
Arabidopsis	`AT4G23820` (AT4G23820) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828482] identity=69.3; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0256100` (OsPGL23) - identity=64.8; qcov=0.93; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28); PF12708 (Pect-lyase_RHGA_epim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057802622.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057802622.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057802622.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802622.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16948801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:16948839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:16948844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:16948890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,A23
`Chr3:16948980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C8
`Chr3:16949034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B16,C15,C49,C75
`Chr3:16949199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,A23,B30
`Chr3:16949230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:16949247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B126,B33,C35,D1
`Chr3:16949271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C61,C66
`Chr3:16949298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:16949352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,B60,C55,C61,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802622.1

446 aa

223

446

Pect-lyase_RHGA_epim

Glyco_hydro_28

PF12708 Pect-lyase_RHGA_epim 46-294 aa PF00295 Glyco_hydro_28 142-418 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802622.1`	Pfam	`PF12708`	Pect-lyase_RHGA_epim	Repeat	46	294	4.5e-13	50.2	Rhamnogalacturonase A/epimerase, pectate lyase-like
`XP_057802622.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	142	418	2.6e-41	142.5	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946639.1
TTCCATGAATAATTCAATAATTTATAGTTTCAAGAAGCACCAGACGTTTACTATCCGTTAATTTATTTTTATCCAATATTTCCGAATTTCCAAAATTCCAAATGCTATCACGAAATAATTGCGAACCTATTTTCTGCTCAAAAGAATCTCTCTCTCTCTTCACACACTCTGCTCTGCCCTGCTCTGTATCTTCCATAATCTCTCTCTCTTCGCGGCAAAGACAAGCGCTTCTTGACAAGCATTACCTCCTTTTTCACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017901
ATGTATCGCTGTGATTGTTCATTTTCGTTTTGTGTTGGGTGGTTATTACTGTTATTTATTAACTTTGGAGAATTCGCGAATGGTGATTGGGCAACTTGCTCCGGGATCGTTCCGATGAGTTACCGGAACGATAAGATATCGATAACGGACTTCGGAGGCGTGGGCGATGGGGTGACGTTGAACACGAAAGCATTCAGAGAAGCAATTTACAGAATCGAGCATTTGAGAAGGAGAGGTGGCTCGCTGCTTTACATTCCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802622.1
MYRCDCSFSFCVGWLLLLFINFGEFANGDWATCSGIVPMSYRNDKISITDFGGVGDGVTLNTKAFREAIYRIEHLRRRGGSLLYIPPGEYLTGPFNLTSRMTLYLARGAVIKATKDVWQWPLIAPLPSYGRGRERPGGRYMSFIHGNGLHDVIITGENGTIDGQGGIWWDMWRRRTLKFTRPNLIEFMNSRSILISNVIFKNSPFWNIHPVYCSHVVIRYVTILAPADSPNTDGIDPDSSSNICIEDSFISTGDDLVAVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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