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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002598`

染色体: Chr03 坐标: 41280298-41281218 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002598`
名称	SmilChr03G002598
描述	cyclin-dependent kinase G-2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41280298 - 41281218 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018814`
GeneID	`131018814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018814`
原始查询	`LOC131018814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinase G-2-like
产物	cyclin-dependent kinase G-2-like
Arabidopsis	`AT1G67580` (AT1G67580) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843079] identity=40.5; qcov=1.01; evalue=3.28e-63; confidence=medium
Rice	`Os04g0488000` (CDKG) - identity=40.3; qcov=0.974; evalue=2.56e-64; confidence=medium
GO	GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF06293 (Kdo); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803503.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803503.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803503.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803503.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803503.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41280603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B42,B43
`Chr3:41280744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr3:41280753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:41280906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B73,C47,C78
`Chr3:41280984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A6,B117,B20,C1
`Chr3:41281089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr3:41281176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803503.1

306 aa

153

306

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kdo

PF00069 Pkinase 31-298 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 34-219 aa PF06293 Kdo 85-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803503.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	31	298	4e-59	200.9	Protein kinase domain
`XP_057803503.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	34	219	2e-25	90.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057803503.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	85	166	2.5e-05	24.5	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947520.1
ATGGGCACCAAGTGTTTAGGGTTAGGCGTTCTTCCAAAGGCTTACTTGGGTGGGGAGCAGGATTTCCAGAAAGATCCCGACGACGAAGAGTACGACATTCTGGATGAGATCAGCCGCGGGTCGTTCGGCGTGGTGTACAGTGCTCGCAACGAGAGAAGCGGCGAAACGGTGGCGATCAAGGAGGAGGTGGGCGGGCTGTGCCCCTCCACCGTAATGGAGATCAGCATCCTCAAATCCCTCCCGCCCCACCCCTGCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018814
ATGGGCACCAAGTGTTTAGGGTTAGGCGTTCTTCCAAAGGCTTACTTGGGTGGGGAGCAGGATTTCCAGAAAGATCCCGACGACGAAGAGTACGACATTCTGGATGAGATCAGCCGCGGGTCGTTCGGCGTGGTGTACAGTGCTCGCAACGAGAGAAGCGGCGAAACGGTGGCGATCAAGGAGGAGGTGGGCGGGCTGTGCCCCTCCACCGTAATGGAGATCAGCATCCTCAAATCCCTCCCGCCCCACCCCTGCATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803503.1
MGTKCLGLGVLPKAYLGGEQDFQKDPDDEEYDILDEISRGSFGVVYSARNERSGETVAIKEEVGGLCPSTVMEISILKSLPPHPCIITFKQAAEGADGGRAYVVMEHMMSDLRRWRLKRRKPYAPIEIKYLMEEILKGVAFLHDHGVMHRDLKPENILLGHNSEVKICDFGLSARFPGQPYSPGVGTLWYMAPELLHGSRDYTCAVDMWAVGATMAELLLDRVLFREDSECHQIWRIRWTMNPPFNFLRRELKLAAAEAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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