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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001793`

染色体: Chr04 坐标: 29357166-29361640 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001793`
名称	SmilChr04G001793
描述	quinolinate synthase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	29357166 - 29361640 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019666`
GeneID	`131019666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019666`
原始查询	`LOC131019666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	quinolinate synthase, chloroplastic
产物	quinolinate synthase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G50210` (QS) quinolinate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835086] identity=65.3; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0290150` (QS) - identity=61; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008987 (quinolinate synthetase A activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0034628 ('de novo' NAD+ biosynthetic process from L-aspartate); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02445 (NadA); PF02657 (SufE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804241.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057804241.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804241.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804241.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:29357825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:29358169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B128,C33
`Chr4:29358307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B53
`Chr4:29359023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:29359267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:29360753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:29360762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B78,C70
`Chr4:29360902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:29360987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr4:29361242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B1
`Chr4:29361307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B55,C23
`Chr4:29361318`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A16,A5,B119,B124,B135,B23,B46,B48,B79,C16,C23,C43,C62,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804241.1

723 aa

362

723

SufE

NadA

PF02657 SufE 85-215 aa PF02445 NadA 266-576 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804241.1`	Pfam	`PF02657`	SufE	Domain	85	215	2.7e-33	115.1	Fe-S metabolism associated domain
`XP_057804241.1`	Pfam	`PF02445`	NadA	Family	266	576	2.7e-28	99.7	Quinolinate synthetase A protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948258.1
GAATCTACAATAATCAAAAGTGACGTAAATTTATATTTGGAGTTTATTCACTGAAATTATTTTTGGTGGGCCCCGCCGCACTACACACTTTTTGCTCTTTTGGCGCGTGATTGGGCGCTTTATCACCACCGCGAATTCATCTCCATATATATCCACACTTTCTTCCTTCCCATCGCGCCGACCTCCACTCTTCTTCCTCTTCTCTGCGCTTTTTTTCCGCTCCAAGTGTTAACCTAAAACGCAGAAAATCTAGCTAGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019666
ATGGACGCAACGGCCATTTCGATGTGTGCTGTCTCTTCAGCTTCCTTCTGCAATTCCAAAAACCCTAAATTCAGCCACGTACCCAGCCCTAATTTGCCGTCCTCGCCACCGATTTTCAGATGCATCTATTCGCAGAGCCCTCATCTTAATTCCTGGAATCCTCTCAAACCGGTTGCGAGAGCTGGTTTCGTTTGCTCGGCTGTGACCTCCGGCGGCGACACGCTCACCTCCGCCGCCGCTAAAGCGAAGGTGCAGAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804241.1
MDATAISMCAVSSASFCNSKNPKFSHVPSPNLPSSPPIFRCIYSQSPHLNSWNPLKPVARAGFVCSAVTSGGDTLTSAAAKAKVQKLIQEFQSLTDPVDRVKRLLHYAELLPSLDDSMKIADNRVPGCTTQVWLRVEMDGGGRMRFSAESDSEITKGFCACLVWALDGATAEEVLSFKAEDFGALSVVGLNGRKVGYSSSRSNTWHNVLISMQKRTKALVAERDGRPRGEPFPSLIVTADGIQAKGSYAEAQARFLVPDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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