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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001072`

染色体: Chr04 坐标: 15419376-15421611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001072`
名称	SmilChr04G001072
描述	histone acetyltransferase TAP1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15419376 - 15421611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019820`
GeneID	`131019820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019820`
原始查询	`LOC131019820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone acetyltransferase TAP1
产物	histone acetyltransferase TAP1
Arabidopsis	`AT1G32070` (NSI) nuclear shuttle interacting [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840099] identity=71.9; qcov=0.923; evalue=8.29e-111; confidence=high
Rice	`Os05g0481000` (OsSNAT1) serotonin N-acetyltransferase 1, chloroplastic-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4339123] identity=72.1; qcov=0.826; evalue=4.03e-98; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008080 (N-acetyltransferase activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00583 (Acetyltransf_1); PF13508 (Acetyltransf_7); PF13673 (Acetyltransf_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804415.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057804415.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804415.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804415.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15420909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr4:15421084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr4:15421327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:15421352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804415.1

247 aa

124

247

Acetyltransf_1

Acetyltransf_7

Acetyltransf_10

PF00583 Acetyltransf_1 114-231 aa PF13508 Acetyltransf_7 160-233 aa PF13673 Acetyltransf_10 160-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804415.1`	Pfam	`PF00583`	Acetyltransf_1	Family	114	231	1.5e-14	55.0	Acetyltransferase (GNAT) family
`XP_057804415.1`	Pfam	`PF13508`	Acetyltransf_7	Domain	160	233	1.6e-12	48.3	Acetyltransferase (GNAT) domain
`XP_057804415.1`	Pfam	`PF13673`	Acetyltransf_10	Domain	160	233	3.6e-11	43.9	Acetyltransferase (GNAT) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948432.1
AAAAGAAAAACAGAAATTTAGAGAGAGAGGAGAAAATCTGGTGCATCCAGAATTCGAGCCCACCACTCCACACAAATCTATCCTAAAAGAATGCCAGCCCACGGACTGGTAGTGTTGCCTCTTGCTGCCTCCGACCTCAATCTCTGCCCGCGAATTGTTTCTTTCGGTTGCCGCTGCCATCCATTTCCTCCCCTCAATTTCCCTCTTTCCACAGGAAGCAGGAAAGAAAAGATTTATAGACTCAAGGCTAGCTTCTGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019820
ATGCCAGCCCACGGACTGGTAGTGTTGCCTCTTGCTGCCTCCGACCTCAATCTCTGCCCGCGAATTGTTTCTTTCGGTTGCCGCTGCCATCCATTTCCTCCCCTCAATTTCCCTCTTTCCACAGGAAGCAGGAAAGAAAAGATTTATAGACTCAAGGCTAGCTTCTGGGAGTCTATTAGATCAGGGATTTTGAAAAACAGTAGTACTCAAGTTGTAGAGCCTCCTGTCACTACTGAAGAAGAGGAAGAGCCCTTGCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804415.1
MPAHGLVVLPLAASDLNLCPRIVSFGCRCHPFPPLNFPLSTGSRKEKIYRLKASFWESIRSGILKNSSTQVVEPPVTTEEEEEPLPEEFVLVESTRPDGTIEQIIFSSGGNIDVYDLQALCDKVGWPRRPLSKLAAALRNSYMVVTLHSISKSTGEEGNDQKKLIGMARATSDHAFNATIWDVLVDPSYQGQGLGKALIEKLIRALLQRDIGNISLFADSKVVEFYRNLGFEPDPEGIKGMFWYPKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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