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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001701`

染色体: Chr01 坐标: 31448616-31451301 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001701`
名称	SmilChr01G001701
描述	uncharacterized SmilChr01G001701
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31448616 - 31451301 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020135`
GeneID	`131020135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020135`
原始查询	`LOC131020135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATPase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837343]; symbol=AT1G08220; hit=AT1G08220; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ATPase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837343]; symbol=AT1G08220; hit=AT1G08220; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G08220` (AT1G08220) ATPase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837343] identity=48.8; qcov=0.973; evalue=2.14e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0176500` - identity=49.1; qcov=0.797; evalue=3.35e-75; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF05176 (ATP-synt_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804804.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057804804.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057804804.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804804.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804804.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31448980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C83
`Chr1:31448991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B104
`Chr1:31449552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B30,C15,C19,C25
`Chr1:31449553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B36,D3
`Chr1:31449578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:31449602`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A24,B118,B21,B36,B66,D3
`Chr1:31449638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:31450047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:31450730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B51
`Chr1:31450738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B30,C19,C25
`Chr1:31450757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:31450799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804804.1

291 aa

146

291

ATP-synt_10

PF05176 ATP-synt_10 39-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804804.1`	Pfam	`PF05176`	ATP-synt_10	Family	39	280	4.6e-33	115.3	ATP10 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948821.1
GGGTCACTTACTAGTTTATGTATTTATAGTAATTAACCCCCTTCGCCCCGCCAACCCCCGTAAGATAACTGGGTTTCTCCTTTCTTTAATGGGTTTCATTCATGTCGAATTGGGCTTCAATCGCTTCACTAATTGCATAGTGAGATTACTGTAACCGTAGTTGCAGAGTTTGCAGAAGGGTTTTTTCCCGCACTCAACATTTTCAGCGTAGTAAATTTGGTGAAAACGAAGAACAAGATGTTGAGATCGAGGAGATTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020135
ATGTTGAGATCGAGGAGATTTCTTTCAGCAGCATTGAGAAATGTAAATGGCGGAGGCTCGCTAAAAAGAGAAGAGAAGTTTTTCCCCGTTATCCCTCTGCGCAACCCCTATCAACGGACTTCTGCTCGATTCCAAGACGTCTATGAGATGGCGACTAAGAGTGCTATTGAGCAATCACGAGCTCGACTTAAAGATGAGATGAGTAGGGGTTACTTTCAAGACATGAAAGACTTGGAGAAACATGGTGGGAAGATATCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804804.1
MLRSRRFLSAALRNVNGGGSLKREEKFFPVIPLRNPYQRTSARFQDVYEMATKSAIEQSRARLKDEMSRGYFQDMKDLEKHGGKISKANKSIVPAKSALKFPTLEVYFPDGSKLELPVTSKEDKENVVSSPKLPLTSKTNDTSVLASDTAKASLICLSFRANSGSMVASWTSPFLKAFARSSDVRLYEVSLIDSWLLSRKLIRKLLLKFMRKPEPAEKQDGLQMKIVYSFGDHYYFRKELKIVNLLTGYVFLLDKSGRIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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