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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003358`

染色体: Chr04 坐标: 50183730-50186953 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003358`
名称	SmilChr04G003358
描述	AP-3 complex subunit delta
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50183730 - 50186953 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020255`
GeneID	`131020255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020255`
原始查询	`LOC131020255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AP-3 complex subunit delta
产物	AP-3 complex subunit delta
Arabidopsis	`AT1G48760` (delta-ADR) delta-adaptin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841298] identity=51.9; qcov=0.96; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0512200` - identity=41.2; qcov=0.971; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0006623 (protein targeting to vacuole); GO:0006896 (Golgi to vacuole transport); GO:0010008 (endosome membrane); GO:0030117 (membrane coat); GO:0030123 (AP-3 adaptor complex)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01602 (Adaptin_N); PF12717 (Cnd1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804944.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804944.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057804944.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804944.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057804944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50183777`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A24,B117,B123,B14,B140,B24,B74,C17,C28,C52,C85
`Chr4:50183792`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A13,B101,B15,B35,B91
`Chr4:50183792`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A13,B101,B15,B35,B91
`Chr4:50183862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:50184008`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A13,A2,A7,A8,B1,B103,B105,B107,B108,B111,B114,B117,B122,B128,B131,B137,B19,B20,B25,B26,B32,B37,B38,B39,B46,B53,B55,B60,B61,B65,B74,B76,B77,B78,B81,B82,B84,B89,B94,B98,C1,C12,C17,C18,C2,C21,C25,C26,C4,C44,C47,C48,C49,C5,C51,C58,C6,C61,C62,C69,C71,C76,C78,C80,C82,D1,D2,D3,D6
`Chr4:50184036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:50184059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C50
`Chr4:50184477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B135
`Chr4:50184668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B75,C73,C74
`Chr4:50184707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:50184757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr4:50184789`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804944.1

982 aa

491

982

Adaptin_N

Cnd1

PF01602 Adaptin_N 89-566 aa PF12717 Cnd1 185-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804944.1`	Pfam	`PF01602`	Adaptin_N	Repeat	89	566	2.5e-80	271.3	Adaptin N terminal region
`XP_057804944.1`	Pfam	`PF12717`	Cnd1	Repeat	185	326	7.3e-11	43.1	non-SMC mitotic condensation complex subunit 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948961.1
GAATTTTACAAGAAGATGAGCACGTGCGCTGCAGAGTCAGCCGGAGTTCATTCTCTGCAGTTTCCCCCAAATCCTCTTCTTCTCGCTCATCGCCATTTTCTCTCTCCTAAATTTCACCGGAGTTCATCTTCTCCGCTGCATGAATTTACACACATCCAATTGCAGAATCGCAGAATCGATCAAATGACGGGGCCTTCACTGATGGACTCTCTCTTCCAGCGCTCCATCGACGACCTAATCAAGGCCCTCCGCCTCACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020255
ATGAGCACGTGCGCTGCAGAGTCAGCCGGAGTTCATTCTCTGCAGTTTCCCCCAAATCCTCTTCTTCTCGCTCATCGCCATTTTCTCTCTCCTAAATTTCACCGGAGTTCATCTTCTCCGCTGCATGAATTTACACACATCCAATTGCAGAATCGCAGAATCGATCAAATGACGGGGCCTTCACTGATGGACTCTCTCTTCCAGCGCTCCATCGACGACCTAATCAAGGCCCTCCGCCTCACCCCGCCGGGCACGGAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804944.1
MSTCAAESAGVHSLQFPPNPLLLAHRHFLSPKFHRSSSSPLHEFTHIQLQNRRIDQMTGPSLMDSLFQRSIDDLIKALRLTPPGTEPAFIAKAIEEIRREIKSTDPQTKSSALQKLTYLHSLHGVDMSWAAFHSVELSSAAAHSHKRTAYVSATLSFNPATTDVILLLTHQLRKDLSSPNVHDVSLALSTLSSICNSDLARDLTPELFTLLSSSKITVRKKAIATVLRVFEQYPDSVRVCFKRVVENLENSDLGILSAVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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