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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003422`

染色体: Chr04 坐标: 50804680-50806395 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003422`
名称	SmilChr04G003422
描述	transcription factor TCP5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50804680 - 50806395 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020306`
GeneID	`131020306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020306`
原始查询	`LOC131020306`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP5-like
产物	transcription factor TCP5-like
Arabidopsis	`AT5G60970` (TCP5) TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea and PCF transcription factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836218] identity=49.2; qcov=0.832; evalue=4.78e-45; confidence=medium
Rice	`Os05g0513100` (OsTCP18) - identity=67; qcov=0.47; evalue=9.02e-42; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805020.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805020.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805020.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805020.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50805176`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr4:50805176`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr4:50805275`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	162	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B111,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B89,B91,B93,B96,B98,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C23,C26,C3,C33,C35,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C70,C71,C72,C73,C76,C80,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr4:50805277`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	163	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B89,B91,B93,B96,B98,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C23,C26,C3,C33,C35,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C47,C48,C49,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C70,C71,C72,C73,C76,C80,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr4:50805360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C5,D2
`Chr4:50805672`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	185	A1,A10,A11,A13,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B106,B107,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B84,B85,B86,B89,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C23,C26,C27,C3,C33,C34,C35,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C76,C79,C80,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr4:50805674`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	179	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B106,B107,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B7,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B82,B85,B86,B89,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C23,C27,C3,C33,C34,C35,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C45,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C76,C79,C80,C81,C83,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr4:50805688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B10,B75,C73,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805020.1

232 aa

116

232

TCP

PF03634 TCP 53-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805020.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	53	113	8.5e-25	88.8	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949037.1
TTCTGCCAACTATATGATTCAACAAGTAGTTCTATCACCCAAATCCTATCTTATTATAGCCATACACAAGTTTTAATTTCCTCTTCTTTTTCTCTCCTTCCTTTCCTTTCCTTTCTAAATTGGAAACCTAATATTCTCTCATATATATCTTGTCCAAAACAGACATAGACAAAGATTTGCAACTCTTGTTTATTCTTGGGTATATACTTGATTTAAGTGATGAAGCAAACATGAGAATGAATCCAAGAGAGAGAGGTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020306
ATGAGAATGAATCCAAGAGAGAGAGGTTTGGGAGGAAAGAAGGAAGAGGACAGCAAATTCCCCAAAATGAGCACCTCCTCTCCCTCTTCCTCATCAAGGCAGTGGTCATCATGCTTCAAGAACCCGAGAATCGTCCGCGTGTCGCGCAGCTTCGGAGGCAAGGACAGGCACAGCAAGGTGTGCACAGTGAAGGGATTGAGAGACAGGAGGATTAGGCTATCAGTGCCTACTGCAATTCAGCTCTATGATCTTCAAGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805020.1
MRMNPRERGLGGKKEEDSKFPKMSTSSPSSSSRQWSSCFKNPRIVRVSRSFGGKDRHSKVCTVKGLRDRRIRLSVPTAIQLYDLQERLGLSQPSKVIDWLLDATKLEIDKLPPLPTNFLQFHQPIATVPLMPNHDPYASEFLSPNLFKTCTDVDQGNSSGEGFGGFNLFPLNSSQFPTPYNNPNYFPIGAPKFVIVSVWGRLWLLQSSRAIQLQPLVVVSSFDFSDLYVSTQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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