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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003434`

染色体: Chr04 坐标: 50902031-50906984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003434`
名称	SmilChr04G003434
描述	cysteine desulfurase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	50902031 - 50906984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020327`
GeneID	`131020327`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020327`
原始查询	`LOC131020327`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine desulfurase 1, chloroplastic
产物	cysteine desulfurase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G08490` (CPNIFS) chloroplastic NIFS-like cysteine desulfurase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837370] identity=82.8; qcov=0.884; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0287300` (OsISC2) - identity=76.8; qcov=0.695; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006534 (GO:0006534); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding); GO:0031071 (cysteine desulfurase activity)
KEGG	smil00450 (Selenocompound metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5); PF01041 (DegT_DnrJ_EryC1); PF01053 (Cys_Met_Meta_PP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020327

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805046.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057805046.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:50902275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:50902329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B26
`Chr4:50902542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:50902976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C5
`Chr4:50903634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B75,C73,C74
`Chr4:50905107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr4:50906155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C17,D3
`Chr4:50906337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B9,C15,C51,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805046.1

466 aa

233

466

Aminotran_5

DegT_DnrJ_EryC1

Cys_Met_Meta_PP

PF00266 Aminotran_5 77-451 aa PF01041 DegT_DnrJ_EryC1 126-258 aa PF01053 Cys_Met_Meta_PP 161-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805046.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	77	451	7.4e-146	486.6	Aminotransferase class-V
`XP_057805046.1`	Pfam	`PF01041`	DegT_DnrJ_EryC1	Domain	126	258	2e-07	31.3	DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family
`XP_057805046.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	161	278	6.8e-09	35.5	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949063.1
TTAATTCAAAAGTAACACTAAATATTCAGCGAAAGAAATTGCAGTTTAGTCCGTTCAATTTCACCAATTCCCGATTCTAATCAAACGAACAGAGCCAATTGCGAAGAATATGAATAAATTGTGGGTGTAATAATAAAAAGTAAGAAGTAGAAAAGCAGCACATGTCGCGGAAGTCAGTTGTGGTGCTAAGCTAACTGTGTTAACTGGTAGCAGCGCTTCTTGGACTTTTGAGCGGCGGCGATGATTATATCAATGGAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020327
ATGATTATATCAATGGAGGCCGTCGTCCTCAAACTCCCGCCCTCTCTCCGCACCATCAAGCCCAACCCTAACCGCACCAACCGCACTCTCCGCACCGCACCCTTCGCTTCCTCCGCCGCCGCTCCGGCTCCTCTTTCAACCGACCCGCAGCTCAGCCCGGGATCCCTCGCGCACCTCACCCGACCCGATTTCCCCATCCTCCACCAGGAGGTGAATGGGAAGAGGCTGGTGTATTTGGATAACGCCGCCACGTCGCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805046.1
MIISMEAVVLKLPPSLRTIKPNPNRTNRTLRTAPFASSAAAPAPLSTDPQLSPGSLAHLTRPDFPILHQEVNGKRLVYLDNAATSQKPAAVVNALRNYYESYNSNVHRGIHYLSAKATDEYELARQKVANFINASECREIVFTRNATEAINLVAYSWGLSNLKEGDEVILTIAEHHSAIVPWQFVAQKTGAVLKFVNLGDDEVPDVEKLREMISKRAKLVVVHHVSNVLASVLPIDQVVSWAHNVGAKVLVDACQSVPHM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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