当前解析结果
SmilChr04G003448| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003448 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003448 |
| 描述 | diacylglycerol kinase 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 50984948 - 50991598 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020342 |
|---|---|
| GeneID | 131020342 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020342 |
| 原始查询 | LOC131020342 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | diacylglycerol kinase 1 |
| 产物 | diacylglycerol kinase 1 |
| Arabidopsis | AT5G07920 (DGK1)diacylglycerol kinase1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830686] identity=71.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os12g0576900- identity=56.3; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004143 (ATP-dependent diacylglycerol kinase activity); GO:0007205 (GO:0007205) |
| KEGG | smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF00130 (C1_1); PF00609 (DAGK_acc); PF00781 (DAGK_cat) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020342 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057805076.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057805076.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057805076.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057805076.1 |
| 5 | Endosome | 内体 | 0.20000 | XP_057805076.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:50985256 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr4:50989322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,B78,B79 |
Chr4:50989533 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr4:50990104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805076.1PF00130
C1_1 150-204 aa
PF00781
DAGK_cat 361-461 aa
PF00609
DAGK_acc 507-664 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805076.1 |
Pfam | PF00130 |
C1_1 | Domain | 150 | 204 | 8.5e-08 | 32.6 | Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) |
XP_057805076.1 |
Pfam | PF00781 |
DAGK_cat | Family | 361 | 461 | 1.2e-27 | 96.7 | Diacylglycerol kinase catalytic domain |
XP_057805076.1 |
Pfam | PF00609 |
DAGK_acc | Family | 507 | 664 | 5.8e-57 | 193.2 | Diacylglycerol kinase accessory domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。