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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003726`

染色体: Chr04 坐标: 53590583-53594431 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003726`
名称	SmilChr04G003726
描述	cationic amino acid transporter 9, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53590583 - 53594431 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020603`
GeneID	`131020603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020603`
原始查询	`LOC131020603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cationic amino acid transporter 9, chloroplastic-like
产物	cationic amino acid transporter 9%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G05940` (CAT9) cationic amino acid transporter 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837104] identity=69.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0655700` (OsCAT2) - identity=70.2; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006865 (amino acid transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2); PF13906 (AA_permease_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057805505.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057805505.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805505.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805505.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53591124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:53591349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:53591375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C14,C79
`Chr4:53591693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:53591824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B132
`Chr4:53591905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:53592068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53592074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:53592077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:53592086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B134
`Chr4:53592259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:53592260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805505.1

563 aa

282

563

AA_permease_2

AA_permease

AA_permease_C

PF13520 AA_permease_2 46-458 aa PF00324 AA_permease 51-424 aa PF13906 AA_permease_C 493-542 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805505.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	46	458	1.4e-52	179.8	Amino acid permease
`XP_057805505.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	51	424	2.5e-32	112.9	Amino acid permease
`XP_057805505.1`	Pfam	`PF13906`	AA_permease_C	Domain	493	542	2.8e-17	63.3	C-terminus of AA_permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949522.1
ATGACGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCCCTTCATTCGTATCTCGTTTCTGCTCATCGGCGCTTCGCTCCAGGCCTCTCTCGCCGCCTACGGACACCGCCGTTCACTCGAGCTCCGACCAAGGCCTCGTTCGCCGCCTAGGCGTATTCGATTTGATTCTACTCGGCATCGGCGCATCTATCGGCGCCGGAATATTCGTCGTCACCGGAACCGTTGCTCGCGACGCTGGTCCTGGAGTGACAATTAGTTTCATCATAGCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020603
ATGACGTCATCTTCCTCCTCCTCCTCCCCTTCATTCGTATCTCGTTTCTGCTCATCGGCGCTTCGCTCCAGGCCTCTCTCGCCGCCTACGGACACCGCCGTTCACTCGAGCTCCGACCAAGGCCTCGTTCGCCGCCTAGGCGTATTCGATTTGATTCTACTCGGCATCGGCGCATCTATCGGCGCCGGAATATTCGTCGTCACCGGAACCGTTGCTCGCGACGCTGGTCCTGGAGTGACAATTAGTTTCATCATAGCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805505.1
MTSSSSSSSPSFVSRFCSSALRSRPLSPPTDTAVHSSSDQGLVRRLGVFDLILLGIGASIGAGIFVVTGTVARDAGPGVTISFIIAGASCVLNALCYAELASRFPAVVGGAYLYTYSAFNELTAFLVFAQLMLDYHIGAASIARSLASYVVTVLELIPFLKDNIPSWVGHGEEVFGALSINVLAPILLVLLTIVLCRGVGESSVLNSVMTVTKVLIVIFVIIVGAFEVDVSNWTPFAPNGVQSILTGSTVVFFSYVGFDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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