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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003754`

染色体: Chr04 坐标: 53810593-53812917 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003754`
名称	SmilChr04G003754
描述	axial regulator YABBY 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53810593 - 53812917 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020634`
GeneID	`131020634`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020634`
原始查询	`LOC131020634`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	axial regulator YABBY 1-like
产物	axial regulator YABBY 1-like
Arabidopsis	`AT2G45190` (AFO) Plant-specific transcription factor YABBY family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819127] identity=65.1; qcov=1.06; evalue=6.22e-89; confidence=high
Rice	`Os04g0536300` (YAB5) - identity=51.6; qcov=1.18; evalue=2.65e-75; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007275 (multicellular organism development); GO:0009944 (polarity specification of adaxial/abaxial axis); GO:0010154 (fruit development); GO:0010158 (abaxial cell fate specification); GO:0045165 (cell fate commitment); GO:1902183 (regulation of shoot apical meristem development); GO:2000024 (regulation of leaf development)
KEGG	-
Pfam	PF04690 (YABBY); PF24868 (YABBY_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020634

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805559.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805559.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805559.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805559.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53812743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A1,A10,A11,A13,A15,A19,A21,A23,A24,A25,A6,A7,A8,B100,B104,B105,B106,B111,B114,B115,B12,B122,B125,B126,B13,B131,B135,B136,B138,B140,B15,B16,B2,B21,B22,B23,B25,B27,B30,B31,B36,B41,B42,B43,B46,B5,B52,B59,B6,B60,B61,B62,B65,B75,B76,B78,B79,B82,B87,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B99,C1,C13,C18,C22,C3,C36,C39,C41,C42,C47,C48,C54,C55,C56,C60,C61,C64,C66,C67,C7,C74,C78,C81,C84,C87,C9,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805559.1

206 aa

103

206

YABBY_N

YABBY

PF24868 YABBY_N 16-69 aa PF04690 YABBY 107-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805559.1`	Pfam	`PF24868`	YABBY_N	Domain	16	69	1.6e-27	95.6	YABBY, N-terminal
`XP_057805559.1`	Pfam	`PF04690`	YABBY	Domain	107	169	1.3e-36	125.4	YABBY protein, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949576.1
AAACACAAACACAAACACAACACCACGCTCTATACATACCTCGACTAGTCAATCAATCAATCAATCAAATCAAATCAATCTCACTGAATTCCATTCAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAATCCCACTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTGTTTATCAAAAAAAGGAAAAAGGAAAAAATGTCATCTTCATCTGCTTTTGCTCCGGACCACCACCTCCTCTCTCCTTCCGGGCAGCTCTGTTACGTCCATTGCAAATTTTGCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020634
ATGTCATCTTCATCTGCTTTTGCTCCGGACCACCACCTCCTCTCTCCTTCCGGGCAGCTCTGTTACGTCCATTGCAAATTTTGCGACACTGTCCTCGCCGTGGGAGTTCCTTGCACCAGCTTGTTCAAGACAGTGACGGTGCGATGCGGCCATTGTTCCAACCTTCTCTCCGTCAACATGCGCGGCTCGCTCCTCCCTTCCCCCAATCATCTCGCCCACTCCCTTTTCTCTCCTCACAATCTTCTGGAGGAGATTCGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805559.1
MSSSSAFAPDHHLLSPSGQLCYVHCKFCDTVLAVGVPCTSLFKTVTVRCGHCSNLLSVNMRGSLLPSPNHLAHSLFSPHNLLEEIRNAPSNLVMNPNDPSFLPREMDELPKPPAAKRPPEKRQRVPSAYNRFIKDEIQRIKAGNPDISHREAFSAAAKNWAHFPHIHFGLMPDQPVKKPNVCQQEGDEILMKDGFLASANIGVSPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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