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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002632`

染色体: Chr04 坐标: 41728798-41730700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002632`
名称	SmilChr04G002632
描述	ferredoxin-3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	41728798 - 41730700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021745`
GeneID	`131021745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021745`
原始查询	`LOC131021745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin-3, chloroplastic-like
产物	ferredoxin-3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G27510` (FD3) ferredoxin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817297] identity=75.3; qcov=0.99; evalue=2.91e-52; confidence=high
Rice	`Os03g0835900` (OsFd3) - identity=80.6; qcov=1; evalue=3.08e-56; confidence=high
GO	GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0009536 (plastid); GO:0022900 (electron transport chain); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00111 (Fer2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057807010.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057807010.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057807010.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807010.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807010.1

98 aa

Fer2

PF00111 Fer2 11-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807010.1`	Pfam	`PF00111`	Fer2	Domain	11	84	1.5e-22	80.0	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101052.1
AGTAAACGAAAGGAAGGGGCTGAGCTAAGCAGGAGGTTGGCGGCACCATTTTTAGGGTATTCCTCTCTCTCATAAATATTAACGGCACTGCCCTGCTGCGCTGCACCCAACTCAAAGAGGCGTTGCGTCTTTCTCTCTCACTTCACAGCTTCAGTGGAGCTTCGAGTGAAGGGCATGGCGCCATGTGCTCGCTCTTCTCATAATGCTCCAAACATCTAACGCTTCGTTGCTGTGAAAATGGATGACCAAATCTGGCTTCC...

XM_057951027.1
AGTAAACGAAAGGAAGGGGCTGAGCTAAGCAGGAGGTTGGCGGCACCATTTTTAGGGTATTCCTCTCTCTCATAAATATTAACGGCACTGCCCTGCTGCGCTGCACCCAACTCAAAGAGGCGTTGCGTCTTTCTCTCTCACTTCACAGCTTCAGGAGAACGGAACATGGCAACTGCAAGGGCTTCCCACAGTTTCCATCTTTGGAAGTGCGCCTCGATGCCAAACCACAAGCGCCTTTGTCAAGATACCGTCCTCTCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021745
ATGGCTGTGTACAAGGTGAAATTGGTTGGGCCGGATGGTGCTGAGTGCGAGTTTGAGGCACCCGACGACTGCTACATCCTCGACTCTGCTGAGTCAGCTGGAGTTGAACTCCCATACTCATGCAGGGCTGGAGCATGCTCCACCTGTGCTGGGAAAATGGTGTCGGGGGCTGTCGACCAGTCTGATGGCTCGTTCCTAGACGACAAACAGATGCAGGAGGGCTACCTGCTGACCTGCGTTTCCTACCCGACTTCAGACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807010.1
MAVYKVKLVGPDGAECEFEAPDDCYILDSAESAGVELPYSCRAGACSTCAGKMVSGAVDQSDGSFLDDKQMQEGYLLTCVSYPTSDCVIHTHKESDLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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