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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002682`

染色体: Chr04 坐标: 42237902-42242788 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002682`
名称	SmilChr04G002682
描述	uncharacterized SmilChr04G002682
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	42237902 - 42242788 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021788`
GeneID	`131021788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021788`
原始查询	`LOC131021788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0383800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0383800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G39680` (AT4G39680) SAP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830123] identity=47.2; qcov=0.52; evalue=6.5e-80; confidence=medium
Rice	`Os03g0383800` - identity=37; qcov=1.05; evalue=7.04e-114; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02037 (SAP); PF16294 (RSB_motif); PF28976 (RRM_ACIN1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807064.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057807064.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807064.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807064.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:42238320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:42238371`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B105,B124,B22,B86,C24,C33,C4,C72
`Chr4:42238382`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B124,B22,B86,C24,C4,C72
`Chr4:42238405`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B124,B22,B45,C24,C4,C72
`Chr4:42238463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,C35,C41,C6
`Chr4:42238512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,C44,C52
`Chr4:42238541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B89,C19,C46,C86
`Chr4:42238542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B91,C29
`Chr4:42238546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:42238610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:42239014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B130,B75
`Chr4:42239078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B59,C23,C57,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807064.1

761 aa

380

761

SAP

RRM_ACIN1

RSB_motif

PF02037 SAP 14-48 aa PF28976 RRM_ACIN1 547-621 aa PF16294 RSB_motif 718-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807064.1`	Pfam	`PF02037`	SAP	Domain	14	48	1.8e-10	40.9	SAP domain
`XP_057807064.1`	Pfam	`PF28976`	RRM_ACIN1	Domain	547	621	1.1e-30	106.3	ACIN1-like, RNA-recognition domain
`XP_057807064.1`	Pfam	`PF16294`	RSB_motif	Motif	718	758	1.2e-12	48.7	RNSP1-SAP18 binding (RSB) motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951081.1
GTATTATAAAATCAATAACCACCAAAATACACAATTACTTACAGCCCACTTCAACCATATATATACAATTCACATTTCATTTTCTAGGGTTATAAATCCTCACAGAGAACGGCGCATTTCACCATCGATTGCTCCGATCAAATTACCAGAAATCATCGTCATCGATTTCTCCGATTAACTTTCCGTTATTCTACTCTTTCATACTAAATTCAACTACGCTTACTTCAACAACTTCTATCAAATTTCTATCACCATAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021788
ATGTCATCACAATATGTTAAACTTGGCAATCGATCAGTTGATCAATGGAAGGTCACTGAGCTGAAGGAAGAGCTCAAGAGACGTAAATTGACTACTACGGGGTTGAAACAAGATCTAGTGAGGCGTTTAGATGAAGCAGTTCGTATTGAAATGCAAAGTTCCTTGGAGGAAGCAGAAAATGAATCTATGCAATCTGAGGTTCCCATTGAAAAAGAAAATGCTGTTACAAATGTTACTGAAAAAACTGAGGATTTTACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807064.1
MSSQYVKLGNRSVDQWKVTELKEELKRRKLTTTGLKQDLVRRLDEAVRIEMQSSLEEAENESMQSEVPIEKENAVTNVTEKTEDFTEREVDIVEKVDPNAGHVIDDCIGSSGEVKVIETDLMQETKSAGLEGGQVPEPPLVETTEVGKIIEPVNTSKASNSQDHGTNEEGDAIILLKDDGSLQEDVKLELSAPNTQSPQINESRTSLAPLNGQDLQCSQTQNEGIHPTDQRENDDSNCLQPDSSGQTLKHQVSEVDPNLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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