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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001918`

染色体: Chr01 坐标: 34317381-34323459 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001918`
名称	SmilChr01G001918
描述	uncharacterized SmilChr01G001918
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34317381 - 34323459 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021790`
GeneID	`131021790`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021790`
原始查询	`LOC131021790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558]; symbol=AT3G44330; hit=AT3G44330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558]; symbol=AT3G44330; hit=AT3G44330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G44330` (AT3G44330) M28 Zn-peptidase nicastrin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823558] identity=73.8; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0102100` - identity=67.3; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0009966 (regulation of signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF04389 (Peptidase_M28); PF05450 (Nicastrin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021790

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057807065.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057807065.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057807065.1`
4	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057807065.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34317733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:34317764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A8,B19,C55
`Chr1:34321565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:34323010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:34323037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:34323038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:34323052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B77,D7
`Chr1:34323142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807065.1

567 aa

284

567

Peptidase_M28

Nicastrin

PF04389 Peptidase_M28 227-331 aa PF05450 Nicastrin 227-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807065.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	227	331	1.6e-05	25.4	Peptidase family M28
`XP_057807065.1`	Pfam	`PF05450`	Nicastrin	Domain	227	331	6.5e-10	39.7	Nicastrin large lobe

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951082.1
TTAGTAGTAGTTATTTAACAAACTACAGCAGTAAAATTGATTACTGATAATAAATACGATACTAATGAGTGCTCGTATAATTAAGACTATCAATATTAAAAATCTCTCACACACAAGCACACACAGATATATAGACTATTTAGACTTGAGACTCCACACTCTTTTCAGATCAAAGCTCCAAAACCTCTACCAATGGCGAAATCTCAGTCGGCGTTGGTGGAGCCGGTGTACTCGTCGGCGATTGCGCTGCTGATTATAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021790
ATGGCGAAATCTCAGTCGGCGTTGGTGGAGCCGGTGTACTCGTCGGCGATTGCGCTGCTGATTATAGTGATGGCGTGCATCGAGCTCTGCGACGCCGTCGCCGTCGTAGATGTATACCGCCTCGTGCAGTACGATCTGGCCGGCGTCCCGTTTGGATCCAGACTAGCCGCCCTCAACCACCACGCCGCCTCTTCTCTCTTCTCATCCTCCGCCGCCGCCGGTGCAGCTGCCGATCTCTCCCGCACCGTCCTTATACTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807065.1
MAKSQSALVEPVYSSAIALLIIVMACIELCDAVAVVDVYRLVQYDLAGVPFGSRLAALNHHAASSLFSSSAAAGAAADLSRTVLILPVRDLNLTFIREYIEEKKPLGGLLLLLPQVFNPQNIDSKDEAGHDSSVGIKKVLLELERLLLHANIPYPVYFGFEDDHVSAVLADVKKNDATGQLATATTGGYKLVVAAPEPKKIVSPTIANIQGWLPGLRADGDSNQLPTIAVVASYDTFGAAPGLSVGSDSNGSGVVALLEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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