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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002838`

染色体: Chr04 坐标: 44522567-44527405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002838`
名称	SmilChr04G002838
描述	GTP-binding protein At2g22870
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	44522567 - 44527405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021925`
GeneID	`131021925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021925`
原始查询	`LOC131021925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein At2g22870
产物	GTP-binding protein At2g22870
Arabidopsis	`AT2G22870` (EMB2001) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816818] identity=68.6; qcov=0.964; evalue=6.61e-153; confidence=high
Rice	`Os03g0232500` - identity=76.4; qcov=0.78; evalue=2.04e-138; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057807248.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057807248.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057807248.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807248.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807248.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:44525072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C11,C69
`Chr4:44525127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C86
`Chr4:44525166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B130,B63,C53
`Chr4:44525211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:44525220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:44525352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:44525360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:44525631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:44526824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A21,B46,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807248.1

304 aa

152

304

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 126-243 aa

XP_057807249.1

304 aa

152

304

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 126-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807248.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	126	243	2e-18	67.3	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057807249.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	126	243	2e-18	67.3	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951266.1
AAAGAAATTAATATTAAAAAAATTGAAAGAAATTTAAGAGCTCTTGCACAGTTGTTGCACTGCTCATTCTTCTCTCTGCGACACAGCTGCTCTCTATCTCTCTCACACACTCTCTCTCGTCTCCGGCCTCTCGGTGCCCCCGCCCTCGCCGGTTTGCCCAATCCCTCGTCTCCCAGTCTCCCTCATCCCCTCTCTTCTTTCTGCGCCACCGGTCTCGCAGACCCGCCCAGCCTCCTCCATCATTGGCGCCTGCGTCAGAA...

XM_057951265.1
ATATATATATATATAGATTCTATTGCAAATGGTATGCATTATTTGTTGTCCGTAAATGTGTTTTTTGAAGACATTATATTAGTGTATTGCATGAGTTGTCTGTCATTATACATATTTACAATTAACAATAAGGATGCGTTACTCTTTGATGGATAAATTTATTATGAAAAATGAGGGATAACAAAAGTTTATACCTTTAAATGCCTTTTTCTTTATTCATAGAGGGATAATATTATCCGTCCTTAAAGTGAAAATAAGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021925
ATGCTGGTGCAGCTACTTCATCGGCTGCTCAGTCCCAATTTCTCATCACTCCGCAACTTCCCATCTCCAAACCCTCACAAGACTCCACCATTTTCTGTTTCACTCCGCGCCTCCATTTCCCAGAAGGCTAACCCCCAATCCTCCTCCGCCCCCAGTCTCCCAAAACCGGAGGCGGCCTCTGAAGCCTCTCGGTTCGCGCGGACCGTGCTATTTGTGCCGCCTGGAGTCCAGCCGGATGAAATCACGGAAGAAAAGGTCCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057807248.1
MLVQLLHRLLSPNFSSLRNFPSPNPHKTPPFSVSLRASISQKANPQSSSAPSLPKPEAASEASRFARTVLFVPPGVQPDEITEEKVLPGSNIVLGPYAGDAKIKEVNFVKSSSRPKECPRDDRPEFAMLGRSNVGKSSLINSLVRKKEVALTSKKPGKTQLINHFLVNKSWYIVDLPGYGFANAPESARMDWSSFTKGYFLNRDTLVSVLLLVDASVPPQKIDLDCANWLGRNNIPMTFVFTKCDKTKGGKAKRPDENIR...

XP_057807249.1
MLVQLLHRLLSPNFSSLRNFPSPNPHKTPPFSVSLRASISQKANPQSSSAPSLPKPEAASEASRFARTVLFVPPGVQPDEITEEKVLPGSNIVLGPYAGDAKIKEVNFVKSSSRPKECPRDDRPEFAMLGRSNVGKSSLINSLVRKKEVALTSKKPGKTQLINHFLVNKSWYIVDLPGYGFANAPESARMDWSSFTKGYFLNRDTLVSVLLLVDASVPPQKIDLDCANWLGRNNIPMTFVFTKCDKTKGGKAKRPDENIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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