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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000098`

染色体: Chr04 坐标: 887017-889490 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000098`
名称	SmilChr04G000098
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	887017 - 889490 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022025`
GeneID	`131022025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022025`
原始查询	`LOC131022025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT3G60730` (AT3G60730) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825244] identity=54.3; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0788400` (OsPME6) - identity=52.4; qcov=0.881; evalue=2.78e-137; confidence=high
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057807370.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057807370.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807370.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807370.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:887065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:887069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B50,C16,C33
`Chr4:887086`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C39
`Chr4:887086`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C39
`Chr4:887089`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,A8,B120,B22,B27,B54,B62,C18,C44,C54
`Chr4:887113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,B82,C53,C66
`Chr4:887120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B72,C25,C43
`Chr4:887126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B114
`Chr4:887137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C73
`Chr4:887144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C53,C64,C66
`Chr4:887145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B86,C10,C71,D5
`Chr4:887210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807370.1

494 aa

247

494

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 31-119 aa PF01095 Pectinesterase 181-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807370.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	31	119	1.3e-11	45.6	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057807370.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	181	480	2e-133	444.4	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951387.1
TTACACCATAAATTAAACCCAAAAAAAAATAAATGTCTTGTTCTTCCACCACCTTGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTCGCCGCCGCCGCAAAATCTGCTCCGACGAGGAAGCATGTTGCGGCGGTGGAATCGGTGAGAGAAGGCATGCAGCAAGCAATAGCTTGGGCCAACGGCGGCGTCAAAACGGCTAGCGGGCCGGGCCCTGAATCGGGCTTTCCCGGTGGGGCCCTCCGCGACTGCGCCGTGCTGTACGGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022025
ATGTCTTGTTCTTCCACCACCTTGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTAGTCGCCGCCGCCGCAAAATCTGCTCCGACGAGGAAGCATGTTGCGGCGGTGGAATCGGTGAGAGAAGGCATGCAGCAAGCAATAGCTTGGGCCAACGGCGGCGTCAAAACGGCTAGCGGGCCGGGCCCTGAATCGGGCTTTCCCGGTGGGGCCCTCCGCGACTGCGCCGTGCTGTACGGAGATGCGGAGTCGAGGCTGGCCCGGTTGGTCTCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807370.1
MSCSSTTLALLLLLLVAAAAKSAPTRKHVAAVESVREGMQQAIAWANGGVKTASGPGPESGFPGGALRDCAVLYGDAESRLARLVSGEAEDWGGDDAVTWLSAALAGHNTCLDGLGEMRGFYEAHNLTNLIREASAVYRAEPETNIGGNAKGKKIVPRRPDPIHEGGLLTAWNPATSNVDYVVAQDGSGNYRTINEAVAAIARSGRNRPERVVVHVKSGVYKEKVEIGRELSNIMFVGDGIDKTIVTGNRNVQDGSTTFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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