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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001943`

染色体: Chr01 坐标: 34615875-34620087 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001943`
名称	SmilChr01G001943
描述	probable aspartyl protease At4g16563
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34615875 - 34620087 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022044`
GeneID	`131022044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022044`
原始查询	`LOC131022044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartyl protease At4g16563
产物	probable aspartyl protease At4g16563
Arabidopsis	`AT3G52500` (AT3G52500) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824415] identity=49.2; qcov=0.992; evalue=1.95e-130; confidence=high
Rice	`Os04g0685200` - identity=41; qcov=0.789; evalue=6.09e-68; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057807400.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057807400.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057807400.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807400.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34618750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C20,C75
`Chr1:34618764`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B103,B32,B53,C56
`Chr1:34618764`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B103,B32,B53,C56
`Chr1:34618766`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B103,B32,B53,C56
`Chr1:34618766`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B103,B32,B53,C56
`Chr1:34618773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B140,C39,D9
`Chr1:34618782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C45
`Chr1:34618788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B33,B54,B82
`Chr1:34619055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34619096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:34619352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34619493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807400.1

399 aa

200

399

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 24-180 aa PF00026 Asp 25-394 aa PF14541 TAXi_C 230-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807400.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	24	180	2.6e-22	80.6	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057807400.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	25	394	2.3e-17	64.1	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057807400.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	230	394	3.3e-32	112.2	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951417.1
ATAAAAATTAGAAATTCTGAGCCCCAAATTCTCGCTCTCTCCTCCCTCCTCTCTCGCCACCGCCCGGCCCCGCCTACTCCGGCAGCAGCACTGCAAGCCTACAGCAAGCTGCACTGCAGCACCAGTACGGCAGACGACAAGGCTTAAAGATGTTGAAGAGCAGCATAAAAAGGTTCTTGAAGAAGATCCTTAGGCGTTTGACTATGATGGAGTATATGATGAAATGACGGAGAAACAAGTTCTTCTTAAAGAGCAAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022044
ATGGCAAGATTTCATCTCCCTCCACCGCCCCTTTGTTCCCCTTCAATGGAGCATACACAGTCTCCCTTCGCCTTCGGCACCCCGCCTCAGTCCATACCGATGATCATCGACACTGGCAGCAGCTTCTCTTGGTTCCCTTGCACCAAGAGATATGTCTGCAGAAACTGCTCTCTCCCTTCAACAGCTATCTCTTCCTTCATGCCTAAGCAATCATCCTCGGCCAAGGTTGTGGGATGCACGAACCCTAAGTGTGGTTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807400.1
MARFHLPPPPLCSPSMEHTQSPFAFGTPPQSIPMIIDTGSSFSWFPCTKRYVCRNCSLPSTAISSFMPKQSSSAKVVGCTNPKCGWLHKPFDPNTSCQDCLLSKANCTQICPPYIILYGVGSTGGVAMVETLSMPHGKIEDFLVGCSLFSSNQPAGVVGFGRGVSSLPSQLGLKKFSYCHVSHKFDNTPRSSFLMMDSDSDSGRKTAELKYTPLLKNPARDEGSALADYYYVNLKKIIVGGRKVEVSHQELVPDEDGNGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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