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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000146`

染色体: Chr04 坐标: 1275963-1281253 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000146`
名称	SmilChr04G000146
描述	uncharacterized SmilChr04G000146
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1275963 - 1281253 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022076`
GeneID	`131022076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022076`
原始查询	`LOC131022076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821261]; symbol=AT3G02460; hit=AT3G02460; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821261]; symbol=AT3G02460; hit=AT3G02460; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G02460` (AT3G02460) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821261] identity=81.7; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0412600` - identity=82.2; qcov=0.77; evalue=9.63e-164; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC); PF23436 (RabGap-TBC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807443.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807443.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057807443.1`
4	Endosome	内体	0.60000	`XP_057807443.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057807443.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1276748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C2
`Chr4:1278315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C2
`Chr4:1279477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C52
`Chr4:1279632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B59
`Chr4:1280243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B23,B44,B60,C50
`Chr4:1280556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C12,D1
`Chr4:1281010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807443.1

357 aa

178

357

RabGAP-TBC

RabGap-TBC_2

PF00566 RabGAP-TBC 86-293 aa PF23436 RabGap-TBC_2 148-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807443.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	86	293	8.9e-60	202.7	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057807443.1`	Pfam	`PF23436`	RabGap-TBC_2	Domain	148	306	6.6e-46	157.4	RabGAP TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951460.1
GCAGATTAGTGATTTTTCTTATTTTTTTCCTTCTAAAAACTTGGGAACGGATTACAATGTTCAAACCCGAGCTTCTTACACGTTTTTTACCAACCGCCAGCGCTGCCATCAATCCGCCGGCGACACGCACCGCCGTCGCGGCACCCCCCAACCACGCGCATCTTACCGGATTTGTTGTTGTGTTTGATATTGAAATGGAGGCTCCATTGGTGCTGACATTGTAGCAGTATCTAGTTCTAGCTTTTGGGGTTTTCTCGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022076
ATGGAAAAGAAACGAGTGGATGAACAAGAGCCCTCGCCTGCCTCACTGCCTAAAGCTGATCGATTTGGATTTGTAAAGCAGGAAACTAACTCACCTGATGGATTAGCAAAGAGCAGATCAGCTGCAGAGTATGAGAGCGAGGAAAGAAGAATTAGAAAATGGAGAAAGATGATAGGGGTTGGAGGAAGTGATTGGAAGCATTATGTTCGCAGGAAACCCCATGTTGTCAAAAGGAGAATAAGGAAAGGAATTCCCGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807443.1
MEKKRVDEQEPSPASLPKADRFGFVKQETNSPDGLAKSRSAAEYESEERRIRKWRKMIGVGGSDWKHYVRRKPHVVKRRIRKGIPDCLRGLVWQLISGSRDLLLMNPGVYEQLVIYETSASELDIIRDISRTFPSHVFFQQRHGPGQRSLYNVLKAYSVYDRDVGYVQGMGFVAGLLLLYMSEEDAFWLLVALLKGAVHAPMEGMYLVGLPLVQQYLFQLDQLVKEQLPELGGHFSQEMINPSMYASQWFITVFSYSFPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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