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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000643`

染色体: Chr04 坐标: 7288847-7293490 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000643`
名称	SmilChr04G000643
描述	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	7288847 - 7293490 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022477`
GeneID	`131022477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022477`
原始查询	`LOC131022477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
产物	serine/threonine-protein kinase ATG1c-like
Arabidopsis	`AT2G37840` (AT2G37840) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818361] identity=53.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0268200` (OsATG1a) - identity=45.8; qcov=1.01; evalue=5.04e-180; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006914 (autophagy); GO:0018105 (peptidyl-serine phosphorylation)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF24497 (MIT_ATG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057807965.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057807965.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057807965.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807965.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:7289131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7289159`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr4:7289159`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr4:7289160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:7289217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr4:7289723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:7289890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C82,C85
`Chr4:7290072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:7290244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:7290286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:7290387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:7290511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807965.1

704 aa

352

704

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

MIT_ATG1

PF00069 Pkinase 12-270 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 14-264 aa PF24497 MIT_ATG1 477-600 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807965.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	12	270	3.3e-73	247.0	Protein kinase domain
`XP_057807965.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	14	264	1.8e-46	159.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057807965.1`	Pfam	`PF24497`	MIT_ATG1	Domain	477	600	1.1e-44	152.3	ATG1, MIT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951982.1
TTCAACAACGCTGTCAATTTGAGGGCGGCTCCGGCCGCCATATAACTGCGGCCGTTGAAGCCAAACCACCAAAATCTCTTATAAAAGAGAACCCCTTTCTTAATTCATCATAAATCTCAAGCGTTGAAGTTTCTTGCACTTAACATCTCTCTTTCACCATTGCCATAAGCAACATTCTTATTTTTGCTTTTTTAAAGAAAAAATATCAAATTTTTAAGGACCCCTCCGATTTATTTCCTCGTCCCTTCGACCTCGCATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022477
ATGTCGCAAAGGGGTTACTACGTGGTGGGGGATTATGTGGTGGGGAAGCAGATTGGTGCGGGCTCCTTCTCGACGGTGTGGCACGCGCGCCACCGCGTCCACGGCACCGAAGTCGCCATCAAAGAGATTGTCACGTCTCGATTGAACCCCAAATTGCAGGAGAGCTTGAAGTCGGAGATTTTCATCCTTAAGAAAATCAATCACCCCAACATCATCCGTTTGCACGACATGATCGAGGAACCAGGAAAGATGTACATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807965.1
MSQRGYYVVGDYVVGKQIGAGSFSTVWHARHRVHGTEVAIKEIVTSRLNPKLQESLKSEIFILKKINHPNIIRLHDMIEEPGKMYIVLEYCRGGDLSMHLQRLQGGIPEATAKHFMQQLAEGLKVLRENNLIHRDLKPQNLLLSSNGDNSILKIADFGFARSLQPLGLAETLCGSPLYMAPEIMQLQRYDAKADLWSVGAILFQLVTGKTPFTGVNQIQLLQNIIKATDLKFPPEAKDLSPHCMDLCRKLLRRNPVERLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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