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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000824`

染色体: Chr04 坐标: 10332171-10341974 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000824`
名称	SmilChr04G000824
描述	uncharacterized SmilChr04G000824
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10332171 - 10341974 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022666`
GeneID	`131022666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022666`
原始查询	`LOC131022666`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820048]; symbol=AT3G08960; hit=AT3G08960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820048]; symbol=AT3G08960; hit=AT3G08960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G08960` (AT3G08960) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820048] identity=71.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0693400` - identity=52.1; qcov=0.407; evalue=2.66e-120; confidence=low
GO	GO:0005635 (nuclear envelope); GO:0005829 (cytosol); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0031267 (small GTPase binding)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03810 (IBN_N); PF25758 (TPR_IPO11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808165.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808165.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057808165.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808165.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10333435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:10334148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B61
`Chr4:10334460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B66,C79
`Chr4:10334946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B58
`Chr4:10337685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:10338623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:10340264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B58,C84
`Chr4:10341311`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B45,C62
`Chr4:10341311`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B45,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808165.1

1001 aa

500

1001

IBN_N

TPR_IPO11

PF03810 IBN_N 29-102 aa PF25758 TPR_IPO11 651-998 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808165.1`	Pfam	`PF03810`	IBN_N	Repeat	29	102	1.2e-16	61.1	Importin-beta N-terminal domain
`XP_057808165.1`	Pfam	`PF25758`	TPR_IPO11	Repeat	651	998	3.5e-62	211.3	Importin-11-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101378.1
CACTGACAATGATTACAGCTCATCTCCTTCCAGCTCGTAAACTTCAGCAGCAGTTTCATTTTGCCCTTCCTCCGCCCCCACCACCGCTTAACCCTCCGCCGGAAAATTCAAACCCTCCGTTCCGCCGCCGTCCGCCGCCTCAGAATTTCGAATTCTATAAGCGGTCGGTCGATTCTCCTGTATCGCTGGACAGCGGCGGTTTCACATTCTCCAGTCAACCCCTCGATCCAAAACCGCTCTTCATTTATACGTCTGACGCA...

XR_009101377.1
ACTGACAATGATTACAGCTCATCTCCTTCCAGCTCGTAAACTTCAGCAGCAGTTTCATTTTGCCCTTCCTCCGCCCCCACCACCGCTTAACCCTCCGCCGGAAAATTCAAACCCTCCGTTCCGCCGCCGTCCGCCGCCTCAGAATTTCGAATTCTATAAGCGGTCGGTCGATTCTCCTGTATCGCTGGACAGCGGCGGTTTCACATTCTCCAGTCAACCCCTCGATCCAAAACCGCTCTTCATTTATACGTCTGACGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022666
ATGGCGCTCACCGTCTCGGACTTGCCGATGATATACAGACTGCTCGCGAATTCAGTCAGCAACGACGTAAATGTGCTGAAGCCGGCGGAAGATGCTCTTGCGCAGTTGGAGAGTAGGCCTGGTTTCTGCTCTTGTCTAATGGAGGTGATAACGGCGAAGGATTTAGCATCGCAGACCGACGTGAGATTGATGGCGTCAGTTTATTTTAAGAACAGCGTTAATCGGTATTGGAGGAACAGACGTGACTCAACGGGTCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808165.1
MALTVSDLPMIYRLLANSVSNDVNVLKPAEDALAQLESRPGFCSCLMEVITAKDLASQTDVRLMASVYFKNSVNRYWRNRRDSTGLSNEEKLHLRQKLLSHLREENPQIAHTLAVLISKIARIDYPKEWPDLLSVLAQQLRSADTLTSHRIFLILFRILKELSTKRLTSDQRTFSEIASQFFDYSWNLWQTDLQKILHGFLVLAQNSPELHQDDMYLICERWFLCSKIIRQLIVSGFPSDSKSIQEVQPVKKVCPVMLNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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