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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002025`

染色体: Chr01 坐标: 35798954-35802168 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002025`
名称	SmilChr01G002025
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35798954 - 35802168 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022828`
GeneID	`131022828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022828`
原始查询	`LOC131022828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic-like
产物	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G45440` (DHDPS2) dihydrodipicolinate synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819152] identity=79.5; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0574800` - identity=79.4; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008840 (4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase activity); GO:0009089 (GO:0009089)
KEGG	smil00261 (Monobactam biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00300 (Lysine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00701 (DHDPS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808342.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057808342.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808342.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808342.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35799357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr1:35799594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B70,B8,C25,C50
`Chr1:35799638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,C64,C66,C70
`Chr1:35799820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:35801197`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr1:35801197`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808342.1

352 aa

176

352

DHDPS

PF00701 DHDPS 53-326 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808342.1`	Pfam	`PF00701`	DHDPS	Domain	53	326	3.5e-91	305.6	Dihydrodipicolinate synthetase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952359.1
CACCTATGGTTCCGGTAATAATGGGTTGAATGAGTACTCAATTGATGGAACGAACGAGTACTACGATTTGAGCTGGACGTGTTTTGACACCTGTCATTAGACAAAAAACCTAATTGATAGCACGTCCGCCGCCATGGCCAATTTATTCAGGTTTTTTTAACTCTACCTCTTCCCCGTATCGTCGCCGCCGCCCCACTCTAGCCGCCGGTGTCGACCTCCGTCCCCAGGAGCTGTCATATTCTAATGCGTCTGAGCTCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022828
ATGGCGTTGGTGATCGGATGTTGCTCTCTCAAGTCTACTCATCGAGGTGTGCTTCCAAAATGGAGATCACCTAGAGCAGCTGTGATTCCCAACTTTCACCTCCCAATGCGTAGTAACGAAGTTAAAAATAGGACTAATGTTGATGACATAAAATCGCTGAGACTGATTACAGCCATCAAGACACCGTATCTCCCGGATGGTAGATTCGACTTGGAGGCCTATGATGCCTTAGTGAACATGCAAATCGAAGATGGTGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808342.1
MALVIGCCSLKSTHRGVLPKWRSPRAAVIPNFHLPMRSNEVKNRTNVDDIKSLRLITAIKTPYLPDGRFDLEAYDALVNMQIEDGVEGVIVGGTTGEGQLMSWDEHIMLIGHTVNCFGSSVKVIGNTGSNSTREAIHATEQGFAVGMHAALHINPYYGKTSLEGLVSHFDSVLPMGPTIIYNVPSRTGQDIPPRVIHTVAQSTNLAGIKECVGNDRVEQYTSNGIVVWSGNDDECHDSRWEYNATGVISVTSNLIPSLMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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