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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000026`

染色体: Chr04 坐标: 270168-273153 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000026`
名称	SmilChr04G000026
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	270168 - 273153 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022838`
GeneID	`131022838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022838`
原始查询	`LOC131022838`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
产物	RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like
Arabidopsis	`AT4G17520` (AT4G17520) Hyaluronan / mRNA binding family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827467] identity=49.6; qcov=1.06; evalue=4.43e-82; confidence=high
Rice	`Os01g0721900` (P0690B02.26-1) - identity=52.3; qcov=1.08; evalue=3.95e-60; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF04774 (HABP4_PAI-RBP1); PF09598 (Stm1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808355.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808355.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057808355.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057808355.1`
5	Stress granule	Stress granule	0.20000	`XP_057808355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:270566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B126,C5,C74,D1
`Chr4:270606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr4:271128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:271141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C49
`Chr4:271159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C40,C62
`Chr4:271227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:271239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:271266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:271756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:272856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:272861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:272883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808355.1

358 aa

179

358

Stm1_N

HABP4_PAI-RBP1

PF09598 Stm1_N 1-69 aa PF04774 HABP4_PAI-RBP1 149-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808355.1`	Pfam	`PF09598`	Stm1_N	Family	1	69	1.3e-20	74.6	Stm1
`XP_057808355.1`	Pfam	`PF04774`	HABP4_PAI-RBP1	Family	149	255	1.2e-25	91.1	Hyaluronan / mRNA binding family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952372.1
AGATAAGATCAACGGATGAGATTACTTCTCTCTTCTTTCTTACATTTAGGCCATTTTCATATAAATAAAAACATTTACGTATATAACAGTCACCGCAGTGTGTTTAGATAAACCTCACTATACTCACTGTTGATTGCGGCTAGGGTTTGGCTCTCTCTTTATCTCTCTCCTCTTCAGTCTCTCACCTCTTCTTCCGGTCTTTCGAGACTCTTAGACCTGTTGATTCGAGACTCTTAGATCTGTTGATTCATACACTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022838
ATGGCGACGCTAAACCCATTCGATTTGCTGGGCGACGATACGGAGGACCCCTCGCTGCTTGCAGCTCAGCAGCAGAAGATCGAGCCCAAAAAAAGCGTTGCACCACCGACCAAGCAGCCAGCGCAGCCGAAGCTCCCCTCCAAGCCGCTGCCCCCGGCTCAGGCTGTAAGAGAGGCAAAATTTGATTCTGCTCGAGGTGGACGTGGTCGAGGACGTGGATATGCTCGTGGTGCTGGTGTGGGCCCCAATAGAGACTTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808355.1
MATLNPFDLLGDDTEDPSLLAAQQQKIEPKKSVAPPTKQPAQPKLPSKPLPPAQAVREAKFDSARGGRGRGRGYARGAGVGPNRDFANNENSYGNKEVFAPQGAPDEVDGKPSERRGGGYGGPRGSFRGGRRGGFSNGDAGEGERDRIRRPLERRSGTGRGTEMKREGAGRGNWGMQTDELAQVTEEVVNEDDKNLNLEKPSGEEDAAENVEKEATKDENEEKPEDKEMTLEEYEKLLEEKRKALLALKSEERKVDAKEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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