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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002955`

染色体: Chr04 坐标: 45876801-45887644 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002955`
名称	SmilChr04G002955
描述	auxin response factor 8-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	45876801 - 45887644 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023759`
GeneID	`131023759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023759`
原始查询	`LOC131023759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 8-like
产物	auxin response factor 8-like
Arabidopsis	`AT5G37020` (ARF8) auxin response factor 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833672] identity=62.5; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0671900` (ARF12) - identity=62; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809313.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809313.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809313.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809313.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809313.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:45877055`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A13,A18,A3,B13,B15,B17,B46,B52,B57,B64,B84,B90,B92,C1,C31,C49,C81
`Chr4:45877108`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A21,A22,B10,B104,B126,B128,B2,B20,B23,B26,B48,B5,B58,B64,B66,B75,C10,C14,C2,C41,C7,C73,C74,C80,C83,C86
`Chr4:45877218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:45877275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C14,C18,C21
`Chr4:45877276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:45877687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:45877979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:45878047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B68
`Chr4:45878278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:45878325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C14,C18,C21
`Chr4:45878471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:45878896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809313.1

889 aa

444

889

ARF_AD

PF02362 B3 137-238 aa PF06507 ARF_AD 286-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809313.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	137	238	1.8e-22	79.9	B3 DNA binding domain
`XP_057809313.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	286	369	1.6e-33	115.2	Auxin response factor ancillary domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953330.1
TGGATGAGGAATTGAGATAGGTGCAGTCCACAAAAAGATGGCGAGGCGAATGGGCTTTGATACCACCTTTCACTTTCACTACATGTCCGTACTGTGAGAGCGACCATGGTCCCACGGACCAGTGATGCCACATGCTCCTGTCACCATCATTTTCCATGCGACGGCCACGATCCGCCGCACGGCTCAATCGACGGCTCATATTTTTCTCCTTTCCATTTGCTAGAGAGAGAGAACGGGGACAGTGACTGAACCTTATTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023759
ATGAGTGAAGTCTCAGATAAAACTATGAAGCTTTCAACATCAGGGGTGGGTCATCATGGTCATGAAGTGTATGAGGAGAAGAAGTGCTTGAACTCGGAGCTATGGCATGCCTGTGCTGGTCCGCTGGTGTCCCTGCCAATGGTAGGCAGCCGCGTGGTTTACTTCCCTCAGGGTCACAGCGAGCAGGTTGCTGCGGCGACTAATAAAGAAGTTGATGCCCATTTCCCCAACTACCCGAGCTTGCCCCCTCAATTGATTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809313.1
MSEVSDKTMKLSTSGVGHHGHEVYEEKKCLNSELWHACAGPLVSLPMVGSRVVYFPQGHSEQVAAATNKEVDAHFPNYPSLPPQLICQLHNVTMHADIETDEVYAQMTLQPLTLQEQKDAYLPVELGMPSRQPTNYFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKVFPPLDFSQTPPAQELIARDLHDAEWKFRHIFRGQPKRHLLTTGWSVFVSAKRLVAGDSVLFIWNDKNQLLLGIRRATRPQTVMPSSVLSSDSMHIGLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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